Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim3Q99PE5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim3Q99PE5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim3Q99PE5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim3Q99PE5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim3Q99PE5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smim3Q99PE5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Smim3Q99PE5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smim3Q99PE5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim3Q99PE5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim3Q99PE5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smim3Q99PE5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smim3Q99PE5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smim3Q99PE5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smim3Q99PE5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smim3Q99PE5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smim3Q99PE5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Smim3Q99PE5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim3Q99PE5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim3Q99PE5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim3Q99PE5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim3Q99PE5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim3Q99PE5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim3Q99PE5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim3Q99PE5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim3Q99PE5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim3Q99PE5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim3Q99PE5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim3Q99PE5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim3Q99PE5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim3Q99PE5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim3Q99PE5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim3Q99PE5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smim3Q99PE5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim3Q99PE5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim3Q99PE5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim3Q99PE5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim3Q99PE5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim3Q99PE5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim3Q99PE5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim3Q99PE5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim3Q99PE5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim3Q99PE5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim3Q99PE5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim3Q99PE5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim3Q99PE5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim3Q99PE5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim3Q99PE5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim3Q99PE5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim3Q99PE5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim3Q99PE5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim3Q99PE5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim3Q99PE5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim3Q99PE5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim3Q99PE5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim3Q99PE5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim3Q99PE5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1203.6 ms