Protein–RNA interactions for Protein: Q99M74

Krt82, Keratin, type II cuticular Hb2, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt82Q99M74 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Krt82Q99M74 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Krt82Q99M74 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Krt82Q99M74 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Krt82Q99M74 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Krt82Q99M74 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Krt82Q99M74 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Krt82Q99M74 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Krt82Q99M74 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Krt82Q99M74 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Krt82Q99M74 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Krt82Q99M74 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Krt82Q99M74 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Krt82Q99M74 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Krt82Q99M74 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Krt82Q99M74 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Krt82Q99M74 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Krt82Q99M74 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Krt82Q99M74 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Krt82Q99M74 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Krt82Q99M74 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Krt82Q99M74 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Krt82Q99M74 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Krt82Q99M74 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Krt82Q99M74 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Krt82Q99M74 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Krt82Q99M74 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Krt82Q99M74 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Krt82Q99M74 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Krt82Q99M74 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Krt82Q99M74 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Krt82Q99M74 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Krt82Q99M74 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Krt82Q99M74 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Krt82Q99M74 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Krt82Q99M74 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Krt82Q99M74 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Krt82Q99M74 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Krt82Q99M74 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Krt82Q99M74 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Krt82Q99M74 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Krt82Q99M74 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Krt82Q99M74 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Krt82Q99M74 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Krt82Q99M74 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Krt82Q99M74 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Krt82Q99M74 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Krt82Q99M74 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Krt82Q99M74 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Krt82Q99M74 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Krt82Q99M74 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Krt82Q99M74 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Krt82Q99M74 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Krt82Q99M74 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Krt82Q99M74 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Krt82Q99M74 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Krt82Q99M74 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Krt82Q99M74 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Krt82Q99M74 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Krt82Q99M74 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Krt82Q99M74 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Krt82Q99M74 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Krt82Q99M74 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Krt82Q99M74 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Krt82Q99M74 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Krt82Q99M74 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Krt82Q99M74 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Krt82Q99M74 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Krt82Q99M74 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Krt82Q99M74 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Krt82Q99M74 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Krt82Q99M74 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Krt82Q99M74 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Krt82Q99M74 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Krt82Q99M74 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Krt82Q99M74 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Krt82Q99M74 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Krt82Q99M74 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Krt82Q99M74 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Krt82Q99M74 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Krt82Q99M74 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Krt82Q99M74 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Krt82Q99M74 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms