Protein–RNA interactions for Protein: Q99LW6

Yaf2, YY1-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yaf2Q99LW6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Yaf2Q99LW6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Yaf2Q99LW6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Yaf2Q99LW6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Yaf2Q99LW6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Yaf2Q99LW6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Yaf2Q99LW6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Yaf2Q99LW6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Yaf2Q99LW6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Yaf2Q99LW6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Yaf2Q99LW6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Yaf2Q99LW6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Yaf2Q99LW6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Yaf2Q99LW6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Yaf2Q99LW6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Yaf2Q99LW6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Yaf2Q99LW6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Yaf2Q99LW6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Yaf2Q99LW6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Yaf2Q99LW6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Yaf2Q99LW6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Yaf2Q99LW6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Yaf2Q99LW6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Yaf2Q99LW6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Yaf2Q99LW6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Yaf2Q99LW6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Yaf2Q99LW6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Yaf2Q99LW6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Yaf2Q99LW6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Yaf2Q99LW6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Yaf2Q99LW6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Yaf2Q99LW6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Yaf2Q99LW6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Yaf2Q99LW6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Yaf2Q99LW6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Yaf2Q99LW6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Yaf2Q99LW6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Yaf2Q99LW6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Yaf2Q99LW6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Yaf2Q99LW6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Yaf2Q99LW6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Yaf2Q99LW6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Yaf2Q99LW6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Yaf2Q99LW6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Yaf2Q99LW6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Yaf2Q99LW6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Yaf2Q99LW6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Yaf2Q99LW6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Yaf2Q99LW6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Yaf2Q99LW6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Yaf2Q99LW6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Yaf2Q99LW6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Yaf2Q99LW6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Yaf2Q99LW6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Yaf2Q99LW6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Yaf2Q99LW6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Yaf2Q99LW6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Yaf2Q99LW6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Yaf2Q99LW6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Yaf2Q99LW6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Yaf2Q99LW6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Yaf2Q99LW6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Yaf2Q99LW6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Yaf2Q99LW6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Yaf2Q99LW6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Yaf2Q99LW6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Yaf2Q99LW6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Yaf2Q99LW6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Yaf2Q99LW6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Yaf2Q99LW6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Yaf2Q99LW6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms