Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcf2Q99LE6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Abcf2Q99LE6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcf2Q99LE6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcf2Q99LE6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcf2Q99LE6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcf2Q99LE6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcf2Q99LE6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcf2Q99LE6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcf2Q99LE6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Abcf2Q99LE6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcf2Q99LE6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcf2Q99LE6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcf2Q99LE6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcf2Q99LE6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcf2Q99LE6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcf2Q99LE6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcf2Q99LE6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcf2Q99LE6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcf2Q99LE6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcf2Q99LE6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcf2Q99LE6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcf2Q99LE6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcf2Q99LE6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcf2Q99LE6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcf2Q99LE6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcf2Q99LE6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcf2Q99LE6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcf2Q99LE6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcf2Q99LE6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcf2Q99LE6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcf2Q99LE6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcf2Q99LE6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcf2Q99LE6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcf2Q99LE6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcf2Q99LE6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcf2Q99LE6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcf2Q99LE6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcf2Q99LE6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcf2Q99LE6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcf2Q99LE6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcf2Q99LE6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcf2Q99LE6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcf2Q99LE6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcf2Q99LE6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcf2Q99LE6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcf2Q99LE6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcf2Q99LE6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcf2Q99LE6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcf2Q99LE6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcf2Q99LE6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcf2Q99LE6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcf2Q99LE6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcf2Q99LE6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcf2Q99LE6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcf2Q99LE6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcf2Q99LE6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcf2Q99LE6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcf2Q99LE6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcf2Q99LE6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcf2Q99LE6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcf2Q99LE6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcf2Q99LE6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcf2Q99LE6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcf2Q99LE6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcf2Q99LE6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcf2Q99LE6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcf2Q99LE6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcf2Q99LE6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcf2Q99LE6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcf2Q99LE6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcf2Q99LE6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcf2Q99LE6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcf2Q99LE6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcf2Q99LE6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcf2Q99LE6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcf2Q99LE6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcf2Q99LE6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcf2Q99LE6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcf2Q99LE6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcf2Q99LE6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcf2Q99LE6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcf2Q99LE6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcf2Q99LE6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcf2Q99LE6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcf2Q99LE6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcf2Q99LE6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcf2Q99LE6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcf2Q99LE6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcf2Q99LE6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcf2Q99LE6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcf2Q99LE6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcf2Q99LE6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcf2Q99LE6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcf2Q99LE6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcf2Q99LE6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcf2Q99LE6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcf2Q99LE6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcf2Q99LE6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcf2Q99LE6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms