Protein–RNA interactions for Protein: Q99L85

Elp5, Elongator complex protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp5Q99L85 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Elp5Q99L85 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Elp5Q99L85 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Elp5Q99L85 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Elp5Q99L85 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Elp5Q99L85 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elp5Q99L85 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Elp5Q99L85 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elp5Q99L85 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elp5Q99L85 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elp5Q99L85 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elp5Q99L85 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Elp5Q99L85 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elp5Q99L85 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elp5Q99L85 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elp5Q99L85 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elp5Q99L85 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elp5Q99L85 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elp5Q99L85 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elp5Q99L85 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elp5Q99L85 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elp5Q99L85 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Elp5Q99L85 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elp5Q99L85 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elp5Q99L85 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Elp5Q99L85 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Elp5Q99L85 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Elp5Q99L85 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Elp5Q99L85 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Elp5Q99L85 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Elp5Q99L85 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Elp5Q99L85 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Elp5Q99L85 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Elp5Q99L85 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Elp5Q99L85 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Elp5Q99L85 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp5Q99L85 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Elp5Q99L85 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elp5Q99L85 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Elp5Q99L85 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Elp5Q99L85 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Elp5Q99L85 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Elp5Q99L85 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Elp5Q99L85 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Elp5Q99L85 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Elp5Q99L85 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Elp5Q99L85 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Elp5Q99L85 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Elp5Q99L85 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Elp5Q99L85 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Elp5Q99L85 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Elp5Q99L85 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Elp5Q99L85 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Elp5Q99L85 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Elp5Q99L85 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Elp5Q99L85 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Elp5Q99L85 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Elp5Q99L85 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Elp5Q99L85 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Elp5Q99L85 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Elp5Q99L85 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms