Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpifQ99KR7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PpifQ99KR7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PpifQ99KR7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PpifQ99KR7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PpifQ99KR7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PpifQ99KR7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PpifQ99KR7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PpifQ99KR7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PpifQ99KR7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PpifQ99KR7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpifQ99KR7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpifQ99KR7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpifQ99KR7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PpifQ99KR7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PpifQ99KR7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PpifQ99KR7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PpifQ99KR7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PpifQ99KR7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PpifQ99KR7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PpifQ99KR7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PpifQ99KR7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PpifQ99KR7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PpifQ99KR7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PpifQ99KR7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PpifQ99KR7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PpifQ99KR7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PpifQ99KR7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PpifQ99KR7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PpifQ99KR7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PpifQ99KR7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PpifQ99KR7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PpifQ99KR7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PpifQ99KR7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PpifQ99KR7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PpifQ99KR7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PpifQ99KR7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PpifQ99KR7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PpifQ99KR7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PpifQ99KR7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PpifQ99KR7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PpifQ99KR7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PpifQ99KR7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PpifQ99KR7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PpifQ99KR7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PpifQ99KR7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PpifQ99KR7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PpifQ99KR7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PpifQ99KR7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PpifQ99KR7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PpifQ99KR7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PpifQ99KR7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpifQ99KR7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpifQ99KR7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpifQ99KR7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpifQ99KR7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpifQ99KR7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpifQ99KR7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PpifQ99KR7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpifQ99KR7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpifQ99KR7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpifQ99KR7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PpifQ99KR7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpifQ99KR7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PpifQ99KR7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PpifQ99KR7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PpifQ99KR7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpifQ99KR7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PpifQ99KR7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpifQ99KR7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PpifQ99KR7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpifQ99KR7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpifQ99KR7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PpifQ99KR7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PpifQ99KR7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpifQ99KR7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PpifQ99KR7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PpifQ99KR7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PpifQ99KR7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PpifQ99KR7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PpifQ99KR7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms