Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed9Q99KF1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed9Q99KF1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed9Q99KF1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed9Q99KF1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed9Q99KF1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed9Q99KF1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed9Q99KF1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed9Q99KF1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed9Q99KF1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed9Q99KF1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed9Q99KF1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed9Q99KF1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed9Q99KF1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmed9Q99KF1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmed9Q99KF1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed9Q99KF1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed9Q99KF1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmed9Q99KF1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmed9Q99KF1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed9Q99KF1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed9Q99KF1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed9Q99KF1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed9Q99KF1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed9Q99KF1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed9Q99KF1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed9Q99KF1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed9Q99KF1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed9Q99KF1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed9Q99KF1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed9Q99KF1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed9Q99KF1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed9Q99KF1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed9Q99KF1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed9Q99KF1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed9Q99KF1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed9Q99KF1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed9Q99KF1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed9Q99KF1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed9Q99KF1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed9Q99KF1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed9Q99KF1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed9Q99KF1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed9Q99KF1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed9Q99KF1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed9Q99KF1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed9Q99KF1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed9Q99KF1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed9Q99KF1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed9Q99KF1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed9Q99KF1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed9Q99KF1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed9Q99KF1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed9Q99KF1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed9Q99KF1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed9Q99KF1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed9Q99KF1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed9Q99KF1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed9Q99KF1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed9Q99KF1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed9Q99KF1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed9Q99KF1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed9Q99KF1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmed9Q99KF1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed9Q99KF1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed9Q99KF1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmed9Q99KF1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmed9Q99KF1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed9Q99KF1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed9Q99KF1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmed9Q99KF1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmed9Q99KF1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmed9Q99KF1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmed9Q99KF1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed9Q99KF1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed9Q99KF1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed9Q99KF1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed9Q99KF1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmed9Q99KF1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms