Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pacsin3Q99JB8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pacsin3Q99JB8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pacsin3Q99JB8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pacsin3Q99JB8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pacsin3Q99JB8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pacsin3Q99JB8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pacsin3Q99JB8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacsin3Q99JB8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pacsin3Q99JB8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacsin3Q99JB8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pacsin3Q99JB8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pacsin3Q99JB8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pacsin3Q99JB8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pacsin3Q99JB8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacsin3Q99JB8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacsin3Q99JB8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pacsin3Q99JB8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pacsin3Q99JB8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pacsin3Q99JB8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pacsin3Q99JB8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacsin3Q99JB8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacsin3Q99JB8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacsin3Q99JB8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacsin3Q99JB8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pacsin3Q99JB8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pacsin3Q99JB8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pacsin3Q99JB8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pacsin3Q99JB8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacsin3Q99JB8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacsin3Q99JB8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacsin3Q99JB8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacsin3Q99JB8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pacsin3Q99JB8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pacsin3Q99JB8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacsin3Q99JB8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacsin3Q99JB8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pacsin3Q99JB8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacsin3Q99JB8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacsin3Q99JB8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pacsin3Q99JB8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pacsin3Q99JB8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin3Q99JB8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pacsin3Q99JB8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pacsin3Q99JB8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pacsin3Q99JB8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin3Q99JB8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin3Q99JB8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin3Q99JB8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pacsin3Q99JB8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pacsin3Q99JB8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pacsin3Q99JB8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pacsin3Q99JB8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pacsin3Q99JB8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pacsin3Q99JB8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pacsin3Q99JB8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pacsin3Q99JB8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pacsin3Q99JB8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pacsin3Q99JB8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pacsin3Q99JB8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pacsin3Q99JB8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms