Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtn4ip1Q924D0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtn4ip1Q924D0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtn4ip1Q924D0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtn4ip1Q924D0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtn4ip1Q924D0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn4ip1Q924D0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn4ip1Q924D0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtn4ip1Q924D0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtn4ip1Q924D0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtn4ip1Q924D0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtn4ip1Q924D0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtn4ip1Q924D0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtn4ip1Q924D0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtn4ip1Q924D0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtn4ip1Q924D0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtn4ip1Q924D0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rtn4ip1Q924D0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn4ip1Q924D0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn4ip1Q924D0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rtn4ip1Q924D0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rtn4ip1Q924D0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtn4ip1Q924D0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rtn4ip1Q924D0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtn4ip1Q924D0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtn4ip1Q924D0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rtn4ip1Q924D0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn4ip1Q924D0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn4ip1Q924D0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rtn4ip1Q924D0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rtn4ip1Q924D0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtn4ip1Q924D0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rtn4ip1Q924D0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rtn4ip1Q924D0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rtn4ip1Q924D0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtn4ip1Q924D0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtn4ip1Q924D0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtn4ip1Q924D0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rtn4ip1Q924D0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtn4ip1Q924D0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtn4ip1Q924D0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rtn4ip1Q924D0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtn4ip1Q924D0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rtn4ip1Q924D0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rtn4ip1Q924D0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rtn4ip1Q924D0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rtn4ip1Q924D0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rtn4ip1Q924D0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms