Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,16■■■■■ 4,18
Clip1Q922J3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,15■■■■■ 4,18
Clip1Q922J3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC41,14■■■■■ 4,18
Clip1Q922J3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC41,14■■■■■ 4,18
Clip1Q922J3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41,14■■■■■ 4,18
Clip1Q922J3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41,1■■■■■ 4,17
Clip1Q922J3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,1■■■■■ 4,17
Clip1Q922J3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Clip1Q922J3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Clip1Q922J3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Clip1Q922J3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC41,07■■■■■ 4,16
Clip1Q922J3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC41,06■■■■■ 4,16
Clip1Q922J3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,05■■■■■ 4,16
Clip1Q922J3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41,04■■■■■ 4,16
Clip1Q922J3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,04■■■■■ 4,16
Clip1Q922J3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC41,03■■■■■ 4,16
Clip1Q922J3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,03■■■■■ 4,16
Clip1Q922J3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,01■■■■■ 4,16
Clip1Q922J3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41■■■■■ 4,15
Clip1Q922J3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC40,99■■■■■ 4,15
Clip1Q922J3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,98■■■■■ 4,15
Clip1Q922J3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC40,94■■■■■ 4,14
Clip1Q922J3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,92■■■■■ 4,14
Clip1Q922J3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Clip1Q922J3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Clip1Q922J3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Clip1Q922J3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Clip1Q922J3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
Clip1Q922J3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC40,85■■■■■ 4,13
Clip1Q922J3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Clip1Q922J3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Clip1Q922J3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC40,79■■■■■ 4,12
Clip1Q922J3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,77■■■■■ 4,12
Clip1Q922J3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Clip1Q922J3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40,75■■■■■ 4,11
Clip1Q922J3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC40,74■■■■■ 4,11
Clip1Q922J3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC40,73■■■■■ 4,11
Clip1Q922J3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
Clip1Q922J3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40,71■■■■■ 4,11
Clip1Q922J3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
Clip1Q922J3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC40,69■■■■■ 4,1
Clip1Q922J3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,69■■■■■ 4,1
Clip1Q922J3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40,68■■■■■ 4,1
Clip1Q922J3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
Clip1Q922J3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC40,66■■■■■ 4,1
Clip1Q922J3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,65■■■■■ 4,1
Clip1Q922J3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,1
Clip1Q922J3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,09
Clip1Q922J3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Clip1Q922J3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40,61■■■■■ 4,09
Clip1Q922J3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,61■■■■■ 4,09
Clip1Q922J3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Clip1Q922J3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC40,59■■■■■ 4,09
Clip1Q922J3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Clip1Q922J3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC40,57■■■■■ 4,08
Clip1Q922J3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Clip1Q922J3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Clip1Q922J3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Clip1Q922J3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Clip1Q922J3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Clip1Q922J3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Clip1Q922J3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Clip1Q922J3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Clip1Q922J3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC40,47■■■■■ 4,07
Clip1Q922J3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40,45■■■■■ 4,07
Clip1Q922J3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC40,44■■■■■ 4,06
Clip1Q922J3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40,44■■■■■ 4,06
Clip1Q922J3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Clip1Q922J3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Clip1Q922J3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Clip1Q922J3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Clip1Q922J3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Clip1Q922J3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC40,4■■■■■ 4,06
Clip1Q922J3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC40,39■■■■■ 4,06
Clip1Q922J3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Clip1Q922J3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Clip1Q922J3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,38■■■■■ 4,06
Clip1Q922J3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
Clip1Q922J3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC40,35■■■■■ 4,05
Clip1Q922J3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40,34■■■■■ 4,05
Clip1Q922J3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,34■■■■■ 4,05
Clip1Q922J3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40,32■■■■■ 4,05
Clip1Q922J3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,32■■■■■ 4,04
Clip1Q922J3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC40,31■■■■■ 4,04
Clip1Q922J3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
Clip1Q922J3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
Clip1Q922J3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Clip1Q922J3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Clip1Q922J3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,28■■■■■ 4,04
Clip1Q922J3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
Clip1Q922J3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC40,23■■■■■ 4,03
Clip1Q922J3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,22■■■■■ 4,03
Clip1Q922J3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
Clip1Q922J3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC40,21■■■■■ 4,03
Clip1Q922J3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC40,2■■■■■ 4,03
Clip1Q922J3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,2■■■■■ 4,03
Clip1Q922J3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,19■■■■■ 4,02
Clip1Q922J3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40,17■■■■■ 4,02
Clip1Q922J3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,15■■■■■ 4,02
Clip1Q922J3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,1 ms