Protein–RNA interactions for Protein: Q91V81

Rbm42, RNA-binding protein 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm42Q91V81 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rbm42Q91V81 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rbm42Q91V81 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Rbm42Q91V81 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Rbm42Q91V81 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Rbm42Q91V81 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Rbm42Q91V81 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Rbm42Q91V81 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Rbm42Q91V81 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Rbm42Q91V81 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rbm42Q91V81 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rbm42Q91V81 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Rbm42Q91V81 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Rbm42Q91V81 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rbm42Q91V81 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rbm42Q91V81 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rbm42Q91V81 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rbm42Q91V81 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Rbm42Q91V81 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Rbm42Q91V81 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Rbm42Q91V81 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Rbm42Q91V81 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Rbm42Q91V81 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Rbm42Q91V81 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Rbm42Q91V81 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Rbm42Q91V81 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Rbm42Q91V81 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Rbm42Q91V81 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Rbm42Q91V81 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Rbm42Q91V81 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Rbm42Q91V81 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Rbm42Q91V81 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Rbm42Q91V81 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Rbm42Q91V81 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Rbm42Q91V81 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Rbm42Q91V81 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Rbm42Q91V81 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Rbm42Q91V81 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Rbm42Q91V81 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Rbm42Q91V81 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Rbm42Q91V81 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Rbm42Q91V81 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Rbm42Q91V81 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Rbm42Q91V81 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Rbm42Q91V81 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Rbm42Q91V81 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Rbm42Q91V81 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Rbm42Q91V81 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Rbm42Q91V81 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Rbm42Q91V81 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Rbm42Q91V81 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Rbm42Q91V81 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Rbm42Q91V81 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Rbm42Q91V81 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Rbm42Q91V81 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Rbm42Q91V81 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Rbm42Q91V81 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Rbm42Q91V81 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Rbm42Q91V81 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Rbm42Q91V81 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rbm42Q91V81 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rbm42Q91V81 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Rbm42Q91V81 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Rbm42Q91V81 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Rbm42Q91V81 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Rbm42Q91V81 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Rbm42Q91V81 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Rbm42Q91V81 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Rbm42Q91V81 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Rbm42Q91V81 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Rbm42Q91V81 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Rbm42Q91V81 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Rbm42Q91V81 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Rbm42Q91V81 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Rbm42Q91V81 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Rbm42Q91V81 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Rbm42Q91V81 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1,91
Rbm42Q91V81 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Rbm42Q91V81 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Rbm42Q91V81 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Rbm42Q91V81 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Rbm42Q91V81 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Rbm42Q91V81 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Rbm42Q91V81 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Rbm42Q91V81 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms