Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE4

Rpa1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa1Q8VEE4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpa1Q8VEE4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpa1Q8VEE4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpa1Q8VEE4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpa1Q8VEE4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpa1Q8VEE4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpa1Q8VEE4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpa1Q8VEE4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpa1Q8VEE4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpa1Q8VEE4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpa1Q8VEE4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpa1Q8VEE4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpa1Q8VEE4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpa1Q8VEE4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpa1Q8VEE4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpa1Q8VEE4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpa1Q8VEE4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpa1Q8VEE4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpa1Q8VEE4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpa1Q8VEE4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpa1Q8VEE4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpa1Q8VEE4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpa1Q8VEE4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpa1Q8VEE4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpa1Q8VEE4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpa1Q8VEE4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpa1Q8VEE4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpa1Q8VEE4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpa1Q8VEE4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpa1Q8VEE4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpa1Q8VEE4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpa1Q8VEE4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpa1Q8VEE4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpa1Q8VEE4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpa1Q8VEE4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpa1Q8VEE4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpa1Q8VEE4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpa1Q8VEE4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpa1Q8VEE4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpa1Q8VEE4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpa1Q8VEE4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpa1Q8VEE4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpa1Q8VEE4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpa1Q8VEE4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpa1Q8VEE4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpa1Q8VEE4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpa1Q8VEE4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpa1Q8VEE4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpa1Q8VEE4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpa1Q8VEE4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpa1Q8VEE4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpa1Q8VEE4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpa1Q8VEE4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpa1Q8VEE4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpa1Q8VEE4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rpa1Q8VEE4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpa1Q8VEE4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpa1Q8VEE4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpa1Q8VEE4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpa1Q8VEE4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpa1Q8VEE4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpa1Q8VEE4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpa1Q8VEE4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpa1Q8VEE4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpa1Q8VEE4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpa1Q8VEE4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpa1Q8VEE4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpa1Q8VEE4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpa1Q8VEE4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpa1Q8VEE4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpa1Q8VEE4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpa1Q8VEE4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpa1Q8VEE4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpa1Q8VEE4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpa1Q8VEE4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpa1Q8VEE4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpa1Q8VEE4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpa1Q8VEE4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpa1Q8VEE4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpa1Q8VEE4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpa1Q8VEE4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpa1Q8VEE4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpa1Q8VEE4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms