Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE96

Slc35f6, Solute carrier family 35 member F6, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35f6Q8VE96 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc35f6Q8VE96 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc35f6Q8VE96 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Slc35f6Q8VE96 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc35f6Q8VE96 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc35f6Q8VE96 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc35f6Q8VE96 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc35f6Q8VE96 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc35f6Q8VE96 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc35f6Q8VE96 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc35f6Q8VE96 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc35f6Q8VE96 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc35f6Q8VE96 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc35f6Q8VE96 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc35f6Q8VE96 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc35f6Q8VE96 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc35f6Q8VE96 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc35f6Q8VE96 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc35f6Q8VE96 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc35f6Q8VE96 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc35f6Q8VE96 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc35f6Q8VE96 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc35f6Q8VE96 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc35f6Q8VE96 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc35f6Q8VE96 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc35f6Q8VE96 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc35f6Q8VE96 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc35f6Q8VE96 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slc35f6Q8VE96 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slc35f6Q8VE96 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc35f6Q8VE96 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc35f6Q8VE96 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc35f6Q8VE96 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc35f6Q8VE96 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc35f6Q8VE96 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc35f6Q8VE96 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc35f6Q8VE96 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc35f6Q8VE96 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc35f6Q8VE96 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc35f6Q8VE96 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc35f6Q8VE96 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc35f6Q8VE96 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc35f6Q8VE96 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slc35f6Q8VE96 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc35f6Q8VE96 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc35f6Q8VE96 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc35f6Q8VE96 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc35f6Q8VE96 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc35f6Q8VE96 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc35f6Q8VE96 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc35f6Q8VE96 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc35f6Q8VE96 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc35f6Q8VE96 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc35f6Q8VE96 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc35f6Q8VE96 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc35f6Q8VE96 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc35f6Q8VE96 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc35f6Q8VE96 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc35f6Q8VE96 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc35f6Q8VE96 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc35f6Q8VE96 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc35f6Q8VE96 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc35f6Q8VE96 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc35f6Q8VE96 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc35f6Q8VE96 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc35f6Q8VE96 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc35f6Q8VE96 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc35f6Q8VE96 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc35f6Q8VE96 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc35f6Q8VE96 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc35f6Q8VE96 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc35f6Q8VE96 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc35f6Q8VE96 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc35f6Q8VE96 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc35f6Q8VE96 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc35f6Q8VE96 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc35f6Q8VE96 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc35f6Q8VE96 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc35f6Q8VE96 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc35f6Q8VE96 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc35f6Q8VE96 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc35f6Q8VE96 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc35f6Q8VE96 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc35f6Q8VE96 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms