Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Dnajc28Q8VCE1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dnajc28Q8VCE1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dnajc28Q8VCE1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dnajc28Q8VCE1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dnajc28Q8VCE1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dnajc28Q8VCE1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajc28Q8VCE1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dnajc28Q8VCE1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnajc28Q8VCE1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dnajc28Q8VCE1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnajc28Q8VCE1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dnajc28Q8VCE1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dnajc28Q8VCE1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Dnajc28Q8VCE1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Dnajc28Q8VCE1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dnajc28Q8VCE1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Dnajc28Q8VCE1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dnajc28Q8VCE1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dnajc28Q8VCE1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Dnajc28Q8VCE1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Dnajc28Q8VCE1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dnajc28Q8VCE1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dnajc28Q8VCE1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dnajc28Q8VCE1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dnajc28Q8VCE1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dnajc28Q8VCE1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dnajc28Q8VCE1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dnajc28Q8VCE1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnajc28Q8VCE1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnajc28Q8VCE1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnajc28Q8VCE1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnajc28Q8VCE1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnajc28Q8VCE1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dnajc28Q8VCE1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dnajc28Q8VCE1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dnajc28Q8VCE1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dnajc28Q8VCE1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dnajc28Q8VCE1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dnajc28Q8VCE1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnajc28Q8VCE1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnajc28Q8VCE1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnajc28Q8VCE1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnajc28Q8VCE1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnajc28Q8VCE1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnajc28Q8VCE1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnajc28Q8VCE1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnajc28Q8VCE1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dnajc28Q8VCE1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnajc28Q8VCE1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnajc28Q8VCE1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnajc28Q8VCE1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnajc28Q8VCE1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnajc28Q8VCE1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnajc28Q8VCE1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnajc28Q8VCE1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnajc28Q8VCE1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnajc28Q8VCE1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnajc28Q8VCE1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dnajc28Q8VCE1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnajc28Q8VCE1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnajc28Q8VCE1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnajc28Q8VCE1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnajc28Q8VCE1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnajc28Q8VCE1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnajc28Q8VCE1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnajc28Q8VCE1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnajc28Q8VCE1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnajc28Q8VCE1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Dnajc28Q8VCE1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnajc28Q8VCE1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnajc28Q8VCE1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnajc28Q8VCE1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnajc28Q8VCE1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dnajc28Q8VCE1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dnajc28Q8VCE1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnajc28Q8VCE1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnajc28Q8VCE1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnajc28Q8VCE1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnajc28Q8VCE1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnajc28Q8VCE1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnajc28Q8VCE1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnajc28Q8VCE1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnajc28Q8VCE1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms