Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms