Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r72Q8K3N7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r72Q8K3N7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r72Q8K3N7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r72Q8K3N7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r72Q8K3N7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r72Q8K3N7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r72Q8K3N7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r72Q8K3N7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r72Q8K3N7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r72Q8K3N7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r72Q8K3N7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r72Q8K3N7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r72Q8K3N7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r72Q8K3N7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r72Q8K3N7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r72Q8K3N7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r72Q8K3N7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r72Q8K3N7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn1r72Q8K3N7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn1r72Q8K3N7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r72Q8K3N7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r72Q8K3N7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r72Q8K3N7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r72Q8K3N7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r72Q8K3N7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r72Q8K3N7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r72Q8K3N7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r72Q8K3N7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r72Q8K3N7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r72Q8K3N7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r72Q8K3N7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r72Q8K3N7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r72Q8K3N7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r72Q8K3N7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r72Q8K3N7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r72Q8K3N7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r72Q8K3N7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r72Q8K3N7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r72Q8K3N7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r72Q8K3N7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn1r72Q8K3N7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r72Q8K3N7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms