Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdh16f2Q8K3M1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdh16f2Q8K3M1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdh16f2Q8K3M1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rdh16f2Q8K3M1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdh16f2Q8K3M1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rdh16f2Q8K3M1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdh16f2Q8K3M1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rdh16f2Q8K3M1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rdh16f2Q8K3M1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rdh16f2Q8K3M1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rdh16f2Q8K3M1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdh16f2Q8K3M1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rdh16f2Q8K3M1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rdh16f2Q8K3M1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rdh16f2Q8K3M1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdh16f2Q8K3M1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdh16f2Q8K3M1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdh16f2Q8K3M1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rdh16f2Q8K3M1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rdh16f2Q8K3M1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdh16f2Q8K3M1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rdh16f2Q8K3M1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rdh16f2Q8K3M1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rdh16f2Q8K3M1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rdh16f2Q8K3M1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rdh16f2Q8K3M1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdh16f2Q8K3M1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdh16f2Q8K3M1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdh16f2Q8K3M1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rdh16f2Q8K3M1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdh16f2Q8K3M1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdh16f2Q8K3M1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rdh16f2Q8K3M1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdh16f2Q8K3M1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rdh16f2Q8K3M1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rdh16f2Q8K3M1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdh16f2Q8K3M1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdh16f2Q8K3M1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rdh16f2Q8K3M1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rdh16f2Q8K3M1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rdh16f2Q8K3M1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdh16f2Q8K3M1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rdh16f2Q8K3M1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdh16f2Q8K3M1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdh16f2Q8K3M1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdh16f2Q8K3M1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rdh16f2Q8K3M1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdh16f2Q8K3M1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdh16f2Q8K3M1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdh16f2Q8K3M1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdh16f2Q8K3M1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdh16f2Q8K3M1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdh16f2Q8K3M1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdh16f2Q8K3M1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdh16f2Q8K3M1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rdh16f2Q8K3M1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdh16f2Q8K3M1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdh16f2Q8K3M1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdh16f2Q8K3M1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdh16f2Q8K3M1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdh16f2Q8K3M1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdh16f2Q8K3M1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh16f2Q8K3M1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh16f2Q8K3M1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rdh16f2Q8K3M1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms