Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scara5Q8K299 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scara5Q8K299 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scara5Q8K299 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scara5Q8K299 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scara5Q8K299 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scara5Q8K299 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scara5Q8K299 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Scara5Q8K299 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scara5Q8K299 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scara5Q8K299 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Scara5Q8K299 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scara5Q8K299 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scara5Q8K299 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scara5Q8K299 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scara5Q8K299 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scara5Q8K299 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Scara5Q8K299 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scara5Q8K299 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scara5Q8K299 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scara5Q8K299 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scara5Q8K299 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scara5Q8K299 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Scara5Q8K299 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Scara5Q8K299 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scara5Q8K299 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scara5Q8K299 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scara5Q8K299 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scara5Q8K299 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scara5Q8K299 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scara5Q8K299 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scara5Q8K299 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scara5Q8K299 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scara5Q8K299 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scara5Q8K299 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scara5Q8K299 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scara5Q8K299 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scara5Q8K299 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scara5Q8K299 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scara5Q8K299 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scara5Q8K299 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scara5Q8K299 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scara5Q8K299 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scara5Q8K299 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scara5Q8K299 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scara5Q8K299 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scara5Q8K299 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scara5Q8K299 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scara5Q8K299 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scara5Q8K299 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scara5Q8K299 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scara5Q8K299 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scara5Q8K299 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scara5Q8K299 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Scara5Q8K299 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Scara5Q8K299 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scara5Q8K299 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scara5Q8K299 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scara5Q8K299 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scara5Q8K299 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scara5Q8K299 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scara5Q8K299 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scara5Q8K299 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scara5Q8K299 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scara5Q8K299 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scara5Q8K299 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scara5Q8K299 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scara5Q8K299 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scara5Q8K299 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scara5Q8K299 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scara5Q8K299 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scara5Q8K299 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scara5Q8K299 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Scara5Q8K299 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scara5Q8K299 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scara5Q8K299 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scara5Q8K299 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scara5Q8K299 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scara5Q8K299 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scara5Q8K299 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scara5Q8K299 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scara5Q8K299 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scara5Q8K299 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scara5Q8K299 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scara5Q8K299 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scara5Q8K299 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scara5Q8K299 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scara5Q8K299 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scara5Q8K299 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scara5Q8K299 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Scara5Q8K299 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scara5Q8K299 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scara5Q8K299 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scara5Q8K299 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scara5Q8K299 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scara5Q8K299 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scara5Q8K299 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scara5Q8K299 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scara5Q8K299 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scara5Q8K299 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms