Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZU6

Pxdc1, PX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pxdc1Q8JZU6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pxdc1Q8JZU6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pxdc1Q8JZU6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pxdc1Q8JZU6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pxdc1Q8JZU6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pxdc1Q8JZU6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pxdc1Q8JZU6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pxdc1Q8JZU6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pxdc1Q8JZU6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pxdc1Q8JZU6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pxdc1Q8JZU6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pxdc1Q8JZU6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pxdc1Q8JZU6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pxdc1Q8JZU6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pxdc1Q8JZU6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pxdc1Q8JZU6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pxdc1Q8JZU6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pxdc1Q8JZU6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pxdc1Q8JZU6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pxdc1Q8JZU6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pxdc1Q8JZU6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pxdc1Q8JZU6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pxdc1Q8JZU6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pxdc1Q8JZU6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pxdc1Q8JZU6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pxdc1Q8JZU6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pxdc1Q8JZU6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pxdc1Q8JZU6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pxdc1Q8JZU6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pxdc1Q8JZU6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pxdc1Q8JZU6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pxdc1Q8JZU6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pxdc1Q8JZU6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pxdc1Q8JZU6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pxdc1Q8JZU6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pxdc1Q8JZU6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pxdc1Q8JZU6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pxdc1Q8JZU6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pxdc1Q8JZU6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pxdc1Q8JZU6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pxdc1Q8JZU6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pxdc1Q8JZU6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pxdc1Q8JZU6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pxdc1Q8JZU6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pxdc1Q8JZU6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pxdc1Q8JZU6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pxdc1Q8JZU6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pxdc1Q8JZU6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pxdc1Q8JZU6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pxdc1Q8JZU6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pxdc1Q8JZU6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pxdc1Q8JZU6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pxdc1Q8JZU6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pxdc1Q8JZU6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pxdc1Q8JZU6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pxdc1Q8JZU6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pxdc1Q8JZU6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pxdc1Q8JZU6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pxdc1Q8JZU6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pxdc1Q8JZU6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pxdc1Q8JZU6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pxdc1Q8JZU6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pxdc1Q8JZU6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pxdc1Q8JZU6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pxdc1Q8JZU6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pxdc1Q8JZU6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 295.2 ms