Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHC4

Synj1, Synaptojanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synj1Q8CHC4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,43■■■■■ 4,86
Synj1Q8CHC4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45,41■■■■■ 4,86
Synj1Q8CHC4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC45,41■■■■■ 4,86
Synj1Q8CHC4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC45,37■■■■■ 4,85
Synj1Q8CHC4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC45,36■■■■■ 4,85
Synj1Q8CHC4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45,35■■■■■ 4,85
Synj1Q8CHC4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC45,35■■■■■ 4,85
Synj1Q8CHC4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC45,35■■■■■ 4,85
Synj1Q8CHC4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC45,33■■■■■ 4,85
Synj1Q8CHC4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45,32■■■■■ 4,85
Synj1Q8CHC4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC45,31■■■■■ 4,84
Synj1Q8CHC4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,31■■■■■ 4,84
Synj1Q8CHC4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,26■■■■■ 4,84
Synj1Q8CHC4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,25■■■■■ 4,83
Synj1Q8CHC4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC45,24■■■■■ 4,83
Synj1Q8CHC4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,23■■■■■ 4,83
Synj1Q8CHC4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45,22■■■■■ 4,83
Synj1Q8CHC4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45,22■■■■■ 4,83
Synj1Q8CHC4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC45,22■■■■■ 4,83
Synj1Q8CHC4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC45,21■■■■■ 4,83
Synj1Q8CHC4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC45,2■■■■■ 4,83
Synj1Q8CHC4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC45,2■■■■■ 4,83
Synj1Q8CHC4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,2■■■■■ 4,83
Synj1Q8CHC4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC45,18■■■■■ 4,82
Synj1Q8CHC4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,18■■■■■ 4,82
Synj1Q8CHC4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,16■■■■■ 4,82
Synj1Q8CHC4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC45,14■■■■■ 4,82
Synj1Q8CHC4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,12■■■■■ 4,81
Synj1Q8CHC4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45,12■■■■■ 4,81
Synj1Q8CHC4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,11■■■■■ 4,81
Synj1Q8CHC4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC45,11■■■■■ 4,81
Synj1Q8CHC4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC45,1■■■■■ 4,81
Synj1Q8CHC4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC45,07■■■■■ 4,81
Synj1Q8CHC4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,07■■■■■ 4,8
Synj1Q8CHC4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,06■■■■■ 4,8
Synj1Q8CHC4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC45,04■■■■■ 4,8
Synj1Q8CHC4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45,03■■■■■ 4,8
Synj1Q8CHC4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC45,02■■■■■ 4,8
Synj1Q8CHC4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC44,98■■■■■ 4,79
Synj1Q8CHC4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,98■■■■■ 4,79
Synj1Q8CHC4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC44,97■■■■■ 4,79
Synj1Q8CHC4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44,95■■■■■ 4,79
Synj1Q8CHC4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44,94■■■■■ 4,78
Synj1Q8CHC4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC44,93■■■■■ 4,78
Synj1Q8CHC4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,92■■■■■ 4,78
Synj1Q8CHC4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC44,9■■■■■ 4,78
Synj1Q8CHC4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC44,87■■■■■ 4,77
Synj1Q8CHC4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,87■■■■■ 4,77
Synj1Q8CHC4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC44,86■■■■■ 4,77
Synj1Q8CHC4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,85■■■■■ 4,77
Synj1Q8CHC4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,82■■■■■ 4,77
Synj1Q8CHC4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,82■■■■■ 4,77
Synj1Q8CHC4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44,82■■■■■ 4,76
Synj1Q8CHC4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC44,81■■■■■ 4,76
Synj1Q8CHC4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,81■■■■■ 4,76
Synj1Q8CHC4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,78■■■■■ 4,76
Synj1Q8CHC4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44,78■■■■■ 4,76
Synj1Q8CHC4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC44,78■■■■■ 4,76
Synj1Q8CHC4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,78■■■■■ 4,76
Synj1Q8CHC4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44,77■■■■■ 4,76
Synj1Q8CHC4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,76■■■■■ 4,76
Synj1Q8CHC4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC44,73■■■■■ 4,75
Synj1Q8CHC4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44,73■■■■■ 4,75
Synj1Q8CHC4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,7■■■■■ 4,75
Synj1Q8CHC4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,68■■■■■ 4,74
Synj1Q8CHC4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC44,68■■■■■ 4,74
Synj1Q8CHC4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,67■■■■■ 4,74
Synj1Q8CHC4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44,66■■■■■ 4,74
Synj1Q8CHC4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC44,66■■■■■ 4,74
Synj1Q8CHC4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,63■■■■■ 4,73
Synj1Q8CHC4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,62■■■■■ 4,73
Synj1Q8CHC4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC44,6■■■■■ 4,73
Synj1Q8CHC4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44,59■■■■■ 4,73
Synj1Q8CHC4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,59■■■■■ 4,73
Synj1Q8CHC4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC44,55■■■■■ 4,72
Synj1Q8CHC4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,55■■■■■ 4,72
Synj1Q8CHC4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,54■■■■■ 4,72
Synj1Q8CHC4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,53■■■■■ 4,72
Synj1Q8CHC4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,51■■■■■ 4,72
Synj1Q8CHC4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44,5■■■■■ 4,71
Synj1Q8CHC4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,49■■■■■ 4,71
Synj1Q8CHC4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44,43■■■■■ 4,7
Synj1Q8CHC4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC44,42■■■■■ 4,7
Synj1Q8CHC4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC44,41■■■■■ 4,7
Synj1Q8CHC4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,4■■■■■ 4,7
Synj1Q8CHC4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC44,4■■■■■ 4,7
Synj1Q8CHC4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,38■■■■■ 4,69
Synj1Q8CHC4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC44,38■■■■■ 4,69
Synj1Q8CHC4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,36■■■■■ 4,69
Synj1Q8CHC4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC44,36■■■■■ 4,69
Synj1Q8CHC4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC44,35■■■■■ 4,69
Synj1Q8CHC4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC44,34■■■■■ 4,69
Synj1Q8CHC4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC44,34■■■■■ 4,69
Synj1Q8CHC4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC44,32■■■■■ 4,69
Synj1Q8CHC4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC44,32■■■■■ 4,69
Synj1Q8CHC4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC44,32■■■■■ 4,68
Synj1Q8CHC4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,31■■■■■ 4,68
Synj1Q8CHC4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC44,31■■■■■ 4,68
Synj1Q8CHC4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,31■■■■■ 4,68
Synj1Q8CHC4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC44,31■■■■■ 4,68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms