Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Polr2bQ8CFI7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Polr2bQ8CFI7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr2bQ8CFI7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr2bQ8CFI7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr2bQ8CFI7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr2bQ8CFI7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Polr2bQ8CFI7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Polr2bQ8CFI7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Polr2bQ8CFI7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Polr2bQ8CFI7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr2bQ8CFI7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr2bQ8CFI7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Polr2bQ8CFI7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr2bQ8CFI7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr2bQ8CFI7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Polr2bQ8CFI7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Polr2bQ8CFI7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Polr2bQ8CFI7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Polr2bQ8CFI7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Polr2bQ8CFI7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr2bQ8CFI7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Polr2bQ8CFI7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr2bQ8CFI7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Polr2bQ8CFI7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Polr2bQ8CFI7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Polr2bQ8CFI7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Polr2bQ8CFI7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Polr2bQ8CFI7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Polr2bQ8CFI7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Polr2bQ8CFI7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr2bQ8CFI7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr2bQ8CFI7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Polr2bQ8CFI7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Polr2bQ8CFI7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr2bQ8CFI7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr2bQ8CFI7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Polr2bQ8CFI7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Polr2bQ8CFI7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Polr2bQ8CFI7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr2bQ8CFI7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr2bQ8CFI7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr2bQ8CFI7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr2bQ8CFI7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr2bQ8CFI7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Polr2bQ8CFI7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Polr2bQ8CFI7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Polr2bQ8CFI7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Polr2bQ8CFI7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr2bQ8CFI7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr2bQ8CFI7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr2bQ8CFI7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr2bQ8CFI7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr2bQ8CFI7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Polr2bQ8CFI7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Polr2bQ8CFI7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr2bQ8CFI7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr2bQ8CFI7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr2bQ8CFI7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr2bQ8CFI7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr2bQ8CFI7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr2bQ8CFI7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr2bQ8CFI7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr2bQ8CFI7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr2bQ8CFI7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr2bQ8CFI7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Polr2bQ8CFI7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr2bQ8CFI7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Polr2bQ8CFI7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr2bQ8CFI7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr2bQ8CFI7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr2bQ8CFI7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Polr2bQ8CFI7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr2bQ8CFI7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr2bQ8CFI7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Polr2bQ8CFI7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr2bQ8CFI7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr2bQ8CFI7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Polr2bQ8CFI7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr2bQ8CFI7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Polr2bQ8CFI7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Polr2bQ8CFI7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms