Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEZ1

Smco1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco1Q8CEZ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smco1Q8CEZ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smco1Q8CEZ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smco1Q8CEZ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smco1Q8CEZ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smco1Q8CEZ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smco1Q8CEZ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smco1Q8CEZ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smco1Q8CEZ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smco1Q8CEZ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smco1Q8CEZ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smco1Q8CEZ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco1Q8CEZ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco1Q8CEZ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco1Q8CEZ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco1Q8CEZ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smco1Q8CEZ1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smco1Q8CEZ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smco1Q8CEZ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smco1Q8CEZ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smco1Q8CEZ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smco1Q8CEZ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smco1Q8CEZ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smco1Q8CEZ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smco1Q8CEZ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smco1Q8CEZ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smco1Q8CEZ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smco1Q8CEZ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smco1Q8CEZ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smco1Q8CEZ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smco1Q8CEZ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smco1Q8CEZ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smco1Q8CEZ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smco1Q8CEZ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smco1Q8CEZ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smco1Q8CEZ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smco1Q8CEZ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smco1Q8CEZ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smco1Q8CEZ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smco1Q8CEZ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smco1Q8CEZ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smco1Q8CEZ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smco1Q8CEZ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smco1Q8CEZ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smco1Q8CEZ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smco1Q8CEZ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smco1Q8CEZ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smco1Q8CEZ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smco1Q8CEZ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smco1Q8CEZ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smco1Q8CEZ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smco1Q8CEZ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms