Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkiras1Q8CEC5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkiras1Q8CEC5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkiras1Q8CEC5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nkiras1Q8CEC5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkiras1Q8CEC5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkiras1Q8CEC5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkiras1Q8CEC5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkiras1Q8CEC5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkiras1Q8CEC5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkiras1Q8CEC5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkiras1Q8CEC5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkiras1Q8CEC5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkiras1Q8CEC5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkiras1Q8CEC5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkiras1Q8CEC5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkiras1Q8CEC5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkiras1Q8CEC5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkiras1Q8CEC5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkiras1Q8CEC5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkiras1Q8CEC5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkiras1Q8CEC5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkiras1Q8CEC5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkiras1Q8CEC5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkiras1Q8CEC5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkiras1Q8CEC5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkiras1Q8CEC5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkiras1Q8CEC5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkiras1Q8CEC5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkiras1Q8CEC5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkiras1Q8CEC5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkiras1Q8CEC5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkiras1Q8CEC5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkiras1Q8CEC5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkiras1Q8CEC5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkiras1Q8CEC5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkiras1Q8CEC5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkiras1Q8CEC5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkiras1Q8CEC5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkiras1Q8CEC5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkiras1Q8CEC5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkiras1Q8CEC5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkiras1Q8CEC5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkiras1Q8CEC5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkiras1Q8CEC5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkiras1Q8CEC5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkiras1Q8CEC5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkiras1Q8CEC5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkiras1Q8CEC5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkiras1Q8CEC5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nkiras1Q8CEC5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkiras1Q8CEC5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkiras1Q8CEC5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms