Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC62

Teddm1b, MCG53738, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm1bQ8CC62 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Teddm1bQ8CC62 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Teddm1bQ8CC62 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Teddm1bQ8CC62 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Teddm1bQ8CC62 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Teddm1bQ8CC62 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Teddm1bQ8CC62 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Teddm1bQ8CC62 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Teddm1bQ8CC62 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Teddm1bQ8CC62 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Teddm1bQ8CC62 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Teddm1bQ8CC62 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Teddm1bQ8CC62 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Teddm1bQ8CC62 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Teddm1bQ8CC62 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Teddm1bQ8CC62 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Teddm1bQ8CC62 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Teddm1bQ8CC62 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Teddm1bQ8CC62 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Teddm1bQ8CC62 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Teddm1bQ8CC62 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Teddm1bQ8CC62 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Teddm1bQ8CC62 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Teddm1bQ8CC62 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Teddm1bQ8CC62 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Teddm1bQ8CC62 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Teddm1bQ8CC62 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Teddm1bQ8CC62 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Teddm1bQ8CC62 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Teddm1bQ8CC62 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Teddm1bQ8CC62 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Teddm1bQ8CC62 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Teddm1bQ8CC62 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Teddm1bQ8CC62 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Teddm1bQ8CC62 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Teddm1bQ8CC62 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Teddm1bQ8CC62 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Teddm1bQ8CC62 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Teddm1bQ8CC62 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Teddm1bQ8CC62 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Teddm1bQ8CC62 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Teddm1bQ8CC62 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Teddm1bQ8CC62 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Teddm1bQ8CC62 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Teddm1bQ8CC62 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Teddm1bQ8CC62 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Teddm1bQ8CC62 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Teddm1bQ8CC62 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Teddm1bQ8CC62 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Teddm1bQ8CC62 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Teddm1bQ8CC62 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Teddm1bQ8CC62 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Teddm1bQ8CC62 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Teddm1bQ8CC62 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Teddm1bQ8CC62 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Teddm1bQ8CC62 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Teddm1bQ8CC62 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Teddm1bQ8CC62 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Teddm1bQ8CC62 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Teddm1bQ8CC62 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Teddm1bQ8CC62 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Teddm1bQ8CC62 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Teddm1bQ8CC62 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Teddm1bQ8CC62 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Teddm1bQ8CC62 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Teddm1bQ8CC62 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Teddm1bQ8CC62 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms