Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Csgalnact2Q8C1F4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Csgalnact2Q8C1F4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Csgalnact2Q8C1F4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Csgalnact2Q8C1F4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Csgalnact2Q8C1F4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Csgalnact2Q8C1F4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Csgalnact2Q8C1F4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Csgalnact2Q8C1F4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Csgalnact2Q8C1F4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Csgalnact2Q8C1F4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Csgalnact2Q8C1F4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Csgalnact2Q8C1F4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Csgalnact2Q8C1F4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Csgalnact2Q8C1F4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Csgalnact2Q8C1F4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Csgalnact2Q8C1F4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Csgalnact2Q8C1F4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Csgalnact2Q8C1F4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Csgalnact2Q8C1F4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Csgalnact2Q8C1F4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Csgalnact2Q8C1F4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csgalnact2Q8C1F4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csgalnact2Q8C1F4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csgalnact2Q8C1F4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Csgalnact2Q8C1F4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Csgalnact2Q8C1F4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Csgalnact2Q8C1F4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Csgalnact2Q8C1F4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csgalnact2Q8C1F4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csgalnact2Q8C1F4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csgalnact2Q8C1F4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Csgalnact2Q8C1F4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Csgalnact2Q8C1F4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Csgalnact2Q8C1F4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Csgalnact2Q8C1F4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Csgalnact2Q8C1F4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Csgalnact2Q8C1F4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Csgalnact2Q8C1F4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Csgalnact2Q8C1F4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Csgalnact2Q8C1F4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Csgalnact2Q8C1F4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Csgalnact2Q8C1F4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Csgalnact2Q8C1F4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Csgalnact2Q8C1F4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Csgalnact2Q8C1F4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Csgalnact2Q8C1F4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Csgalnact2Q8C1F4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Csgalnact2Q8C1F4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Csgalnact2Q8C1F4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Csgalnact2Q8C1F4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Csgalnact2Q8C1F4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Csgalnact2Q8C1F4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Csgalnact2Q8C1F4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csgalnact2Q8C1F4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csgalnact2Q8C1F4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Csgalnact2Q8C1F4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Csgalnact2Q8C1F4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csgalnact2Q8C1F4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Csgalnact2Q8C1F4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Csgalnact2Q8C1F4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Csgalnact2Q8C1F4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Csgalnact2Q8C1F4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Csgalnact2Q8C1F4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Csgalnact2Q8C1F4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Csgalnact2Q8C1F4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Csgalnact2Q8C1F4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Csgalnact2Q8C1F4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Csgalnact2Q8C1F4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Csgalnact2Q8C1F4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Csgalnact2Q8C1F4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Csgalnact2Q8C1F4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Csgalnact2Q8C1F4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Csgalnact2Q8C1F4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Csgalnact2Q8C1F4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Csgalnact2Q8C1F4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms