Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdf3Q8BYK6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdf3Q8BYK6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdf3Q8BYK6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ythdf3Q8BYK6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdf3Q8BYK6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdf3Q8BYK6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdf3Q8BYK6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdf3Q8BYK6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdf3Q8BYK6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdf3Q8BYK6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdf3Q8BYK6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdf3Q8BYK6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdf3Q8BYK6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdf3Q8BYK6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdf3Q8BYK6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdf3Q8BYK6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdf3Q8BYK6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdf3Q8BYK6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdf3Q8BYK6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdf3Q8BYK6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdf3Q8BYK6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdf3Q8BYK6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ythdf3Q8BYK6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdf3Q8BYK6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdf3Q8BYK6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdf3Q8BYK6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ythdf3Q8BYK6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ythdf3Q8BYK6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ythdf3Q8BYK6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdf3Q8BYK6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ythdf3Q8BYK6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ythdf3Q8BYK6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ythdf3Q8BYK6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ythdf3Q8BYK6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ythdf3Q8BYK6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ythdf3Q8BYK6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ythdf3Q8BYK6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ythdf3Q8BYK6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ythdf3Q8BYK6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ythdf3Q8BYK6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ythdf3Q8BYK6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ythdf3Q8BYK6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ythdf3Q8BYK6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ythdf3Q8BYK6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ythdf3Q8BYK6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ythdf3Q8BYK6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdf3Q8BYK6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ythdf3Q8BYK6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdf3Q8BYK6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ythdf3Q8BYK6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdf3Q8BYK6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ythdf3Q8BYK6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ythdf3Q8BYK6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ythdf3Q8BYK6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdf3Q8BYK6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ythdf3Q8BYK6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ythdf3Q8BYK6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdf3Q8BYK6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ythdf3Q8BYK6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ythdf3Q8BYK6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ythdf3Q8BYK6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ythdf3Q8BYK6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ythdf3Q8BYK6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdf3Q8BYK6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ythdf3Q8BYK6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdf3Q8BYK6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ythdf3Q8BYK6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ythdf3Q8BYK6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ythdf3Q8BYK6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ythdf3Q8BYK6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ythdf3Q8BYK6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ythdf3Q8BYK6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ythdf3Q8BYK6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ythdf3Q8BYK6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ythdf3Q8BYK6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ythdf3Q8BYK6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ythdf3Q8BYK6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ythdf3Q8BYK6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ythdf3Q8BYK6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ythdf3Q8BYK6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ythdf3Q8BYK6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ythdf3Q8BYK6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ythdf3Q8BYK6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ythdf3Q8BYK6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms