Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TnrQ8BYI9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TnrQ8BYI9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TnrQ8BYI9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TnrQ8BYI9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TnrQ8BYI9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TnrQ8BYI9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
TnrQ8BYI9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
TnrQ8BYI9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TnrQ8BYI9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TnrQ8BYI9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TnrQ8BYI9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TnrQ8BYI9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TnrQ8BYI9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TnrQ8BYI9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TnrQ8BYI9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TnrQ8BYI9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
TnrQ8BYI9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TnrQ8BYI9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TnrQ8BYI9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TnrQ8BYI9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
TnrQ8BYI9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TnrQ8BYI9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TnrQ8BYI9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TnrQ8BYI9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TnrQ8BYI9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TnrQ8BYI9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TnrQ8BYI9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TnrQ8BYI9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TnrQ8BYI9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TnrQ8BYI9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TnrQ8BYI9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TnrQ8BYI9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TnrQ8BYI9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TnrQ8BYI9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TnrQ8BYI9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TnrQ8BYI9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TnrQ8BYI9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TnrQ8BYI9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TnrQ8BYI9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TnrQ8BYI9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TnrQ8BYI9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TnrQ8BYI9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TnrQ8BYI9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TnrQ8BYI9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TnrQ8BYI9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TnrQ8BYI9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TnrQ8BYI9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TnrQ8BYI9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TnrQ8BYI9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TnrQ8BYI9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TnrQ8BYI9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TnrQ8BYI9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TnrQ8BYI9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TnrQ8BYI9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TnrQ8BYI9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TnrQ8BYI9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TnrQ8BYI9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TnrQ8BYI9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TnrQ8BYI9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TnrQ8BYI9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TnrQ8BYI9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TnrQ8BYI9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TnrQ8BYI9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TnrQ8BYI9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TnrQ8BYI9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TnrQ8BYI9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
TnrQ8BYI9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TnrQ8BYI9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TnrQ8BYI9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TnrQ8BYI9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TnrQ8BYI9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.78■■■■□ 3
TnrQ8BYI9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TnrQ8BYI9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TnrQ8BYI9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TnrQ8BYI9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TnrQ8BYI9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TnrQ8BYI9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TnrQ8BYI9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TnrQ8BYI9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TnrQ8BYI9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TnrQ8BYI9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TnrQ8BYI9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TnrQ8BYI9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TnrQ8BYI9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TnrQ8BYI9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TnrQ8BYI9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TnrQ8BYI9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TnrQ8BYI9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TnrQ8BYI9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TnrQ8BYI9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TnrQ8BYI9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TnrQ8BYI9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
TnrQ8BYI9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TnrQ8BYI9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TnrQ8BYI9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TnrQ8BYI9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TnrQ8BYI9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TnrQ8BYI9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TnrQ8BYI9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms