Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWU1

Sprn, Shadow of prion protein, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprnQ8BWU1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SprnQ8BWU1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SprnQ8BWU1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SprnQ8BWU1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SprnQ8BWU1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SprnQ8BWU1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SprnQ8BWU1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SprnQ8BWU1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SprnQ8BWU1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SprnQ8BWU1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SprnQ8BWU1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SprnQ8BWU1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SprnQ8BWU1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SprnQ8BWU1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SprnQ8BWU1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SprnQ8BWU1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SprnQ8BWU1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SprnQ8BWU1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SprnQ8BWU1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SprnQ8BWU1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SprnQ8BWU1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SprnQ8BWU1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SprnQ8BWU1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SprnQ8BWU1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SprnQ8BWU1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SprnQ8BWU1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SprnQ8BWU1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SprnQ8BWU1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SprnQ8BWU1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SprnQ8BWU1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SprnQ8BWU1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SprnQ8BWU1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SprnQ8BWU1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SprnQ8BWU1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SprnQ8BWU1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SprnQ8BWU1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SprnQ8BWU1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SprnQ8BWU1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SprnQ8BWU1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SprnQ8BWU1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SprnQ8BWU1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SprnQ8BWU1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SprnQ8BWU1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SprnQ8BWU1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SprnQ8BWU1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SprnQ8BWU1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SprnQ8BWU1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SprnQ8BWU1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SprnQ8BWU1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SprnQ8BWU1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SprnQ8BWU1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SprnQ8BWU1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SprnQ8BWU1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SprnQ8BWU1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SprnQ8BWU1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SprnQ8BWU1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SprnQ8BWU1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SprnQ8BWU1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SprnQ8BWU1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SprnQ8BWU1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SprnQ8BWU1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SprnQ8BWU1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SprnQ8BWU1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SprnQ8BWU1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SprnQ8BWU1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SprnQ8BWU1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SprnQ8BWU1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SprnQ8BWU1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SprnQ8BWU1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SprnQ8BWU1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SprnQ8BWU1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SprnQ8BWU1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SprnQ8BWU1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SprnQ8BWU1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SprnQ8BWU1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SprnQ8BWU1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SprnQ8BWU1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SprnQ8BWU1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SprnQ8BWU1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SprnQ8BWU1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SprnQ8BWU1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SprnQ8BWU1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms