Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rccd1Q8BTU7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rccd1Q8BTU7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rccd1Q8BTU7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rccd1Q8BTU7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rccd1Q8BTU7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rccd1Q8BTU7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rccd1Q8BTU7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rccd1Q8BTU7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rccd1Q8BTU7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rccd1Q8BTU7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rccd1Q8BTU7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rccd1Q8BTU7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rccd1Q8BTU7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rccd1Q8BTU7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rccd1Q8BTU7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rccd1Q8BTU7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rccd1Q8BTU7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rccd1Q8BTU7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rccd1Q8BTU7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rccd1Q8BTU7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rccd1Q8BTU7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rccd1Q8BTU7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rccd1Q8BTU7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rccd1Q8BTU7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rccd1Q8BTU7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rccd1Q8BTU7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rccd1Q8BTU7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rccd1Q8BTU7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rccd1Q8BTU7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rccd1Q8BTU7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rccd1Q8BTU7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rccd1Q8BTU7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rccd1Q8BTU7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rccd1Q8BTU7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rccd1Q8BTU7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rccd1Q8BTU7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rccd1Q8BTU7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rccd1Q8BTU7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rccd1Q8BTU7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rccd1Q8BTU7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rccd1Q8BTU7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rccd1Q8BTU7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rccd1Q8BTU7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rccd1Q8BTU7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rccd1Q8BTU7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rccd1Q8BTU7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rccd1Q8BTU7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rccd1Q8BTU7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rccd1Q8BTU7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rccd1Q8BTU7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms