Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
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Tspan9Q8BJU2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tspan9Q8BJU2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tspan9Q8BJU2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan9Q8BJU2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan9Q8BJU2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan9Q8BJU2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Tspan9Q8BJU2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Tspan9Q8BJU2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan9Q8BJU2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Tspan9Q8BJU2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan9Q8BJU2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Tspan9Q8BJU2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan9Q8BJU2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan9Q8BJU2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan9Q8BJU2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan9Q8BJU2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Tspan9Q8BJU2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Tspan9Q8BJU2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Tspan9Q8BJU2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Tspan9Q8BJU2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan9Q8BJU2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Tspan9Q8BJU2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Tspan9Q8BJU2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan9Q8BJU2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan9Q8BJU2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan9Q8BJU2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tspan9Q8BJU2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tspan9Q8BJU2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Tspan9Q8BJU2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Tspan9Q8BJU2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan9Q8BJU2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan9Q8BJU2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Tspan9Q8BJU2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tspan9Q8BJU2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tspan9Q8BJU2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tspan9Q8BJU2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan9Q8BJU2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan9Q8BJU2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan9Q8BJU2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan9Q8BJU2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tspan9Q8BJU2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan9Q8BJU2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan9Q8BJU2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tspan9Q8BJU2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan9Q8BJU2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan9Q8BJU2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan9Q8BJU2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan9Q8BJU2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan9Q8BJU2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan9Q8BJU2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan9Q8BJU2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan9Q8BJU2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan9Q8BJU2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan9Q8BJU2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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