Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJF9

Chmp2b, Charged multivesicular body protein 2b, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2bQ8BJF9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Chmp2bQ8BJF9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp2bQ8BJF9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp2bQ8BJF9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp2bQ8BJF9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp2bQ8BJF9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp2bQ8BJF9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp2bQ8BJF9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp2bQ8BJF9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp2bQ8BJF9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp2bQ8BJF9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp2bQ8BJF9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp2bQ8BJF9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp2bQ8BJF9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp2bQ8BJF9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp2bQ8BJF9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp2bQ8BJF9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp2bQ8BJF9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp2bQ8BJF9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp2bQ8BJF9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp2bQ8BJF9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp2bQ8BJF9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp2bQ8BJF9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp2bQ8BJF9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp2bQ8BJF9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp2bQ8BJF9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp2bQ8BJF9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp2bQ8BJF9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chmp2bQ8BJF9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp2bQ8BJF9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp2bQ8BJF9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp2bQ8BJF9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chmp2bQ8BJF9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chmp2bQ8BJF9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp2bQ8BJF9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chmp2bQ8BJF9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp2bQ8BJF9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp2bQ8BJF9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp2bQ8BJF9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp2bQ8BJF9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp2bQ8BJF9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms