Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pld4Q8BG07 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pld4Q8BG07 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pld4Q8BG07 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pld4Q8BG07 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pld4Q8BG07 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pld4Q8BG07 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pld4Q8BG07 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pld4Q8BG07 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pld4Q8BG07 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pld4Q8BG07 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pld4Q8BG07 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pld4Q8BG07 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pld4Q8BG07 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pld4Q8BG07 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pld4Q8BG07 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pld4Q8BG07 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pld4Q8BG07 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pld4Q8BG07 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pld4Q8BG07 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pld4Q8BG07 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pld4Q8BG07 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pld4Q8BG07 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pld4Q8BG07 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pld4Q8BG07 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pld4Q8BG07 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pld4Q8BG07 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pld4Q8BG07 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pld4Q8BG07 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pld4Q8BG07 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pld4Q8BG07 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pld4Q8BG07 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pld4Q8BG07 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pld4Q8BG07 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pld4Q8BG07 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pld4Q8BG07 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pld4Q8BG07 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pld4Q8BG07 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pld4Q8BG07 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pld4Q8BG07 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pld4Q8BG07 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pld4Q8BG07 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pld4Q8BG07 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pld4Q8BG07 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pld4Q8BG07 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pld4Q8BG07 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pld4Q8BG07 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pld4Q8BG07 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pld4Q8BG07 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pld4Q8BG07 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pld4Q8BG07 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pld4Q8BG07 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pld4Q8BG07 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pld4Q8BG07 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pld4Q8BG07 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pld4Q8BG07 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pld4Q8BG07 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pld4Q8BG07 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pld4Q8BG07 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pld4Q8BG07 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pld4Q8BG07 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pld4Q8BG07 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pld4Q8BG07 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pld4Q8BG07 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pld4Q8BG07 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pld4Q8BG07 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pld4Q8BG07 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pld4Q8BG07 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pld4Q8BG07 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pld4Q8BG07 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pld4Q8BG07 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pld4Q8BG07 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pld4Q8BG07 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pld4Q8BG07 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pld4Q8BG07 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pld4Q8BG07 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pld4Q8BG07 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pld4Q8BG07 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pld4Q8BG07 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pld4Q8BG07 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pld4Q8BG07 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pld4Q8BG07 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pld4Q8BG07 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pld4Q8BG07 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pld4Q8BG07 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms