Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc50Q810U5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc50Q810U5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc50Q810U5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc50Q810U5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc50Q810U5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc50Q810U5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc50Q810U5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc50Q810U5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc50Q810U5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc50Q810U5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc50Q810U5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc50Q810U5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc50Q810U5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc50Q810U5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc50Q810U5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc50Q810U5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc50Q810U5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc50Q810U5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc50Q810U5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc50Q810U5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc50Q810U5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc50Q810U5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc50Q810U5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc50Q810U5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc50Q810U5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc50Q810U5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc50Q810U5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc50Q810U5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc50Q810U5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc50Q810U5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc50Q810U5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc50Q810U5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc50Q810U5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc50Q810U5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc50Q810U5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc50Q810U5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc50Q810U5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc50Q810U5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc50Q810U5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc50Q810U5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc50Q810U5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc50Q810U5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc50Q810U5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc50Q810U5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc50Q810U5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc50Q810U5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc50Q810U5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc50Q810U5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc50Q810U5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc50Q810U5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc50Q810U5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc50Q810U5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc50Q810U5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc50Q810U5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc50Q810U5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc50Q810U5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc50Q810U5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc50Q810U5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc50Q810U5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc50Q810U5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc50Q810U5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc50Q810U5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc50Q810U5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc50Q810U5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc50Q810U5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms