Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc1Q80VQ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc1Q80VQ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc1Q80VQ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc1Q80VQ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc1Q80VQ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc1Q80VQ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc1Q80VQ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc1Q80VQ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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