Protein–RNA interactions for Protein: Q80UB0

Testin-2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80UB0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q80UB0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q80UB0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q80UB0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q80UB0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q80UB0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Q80UB0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q80UB0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q80UB0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q80UB0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q80UB0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q80UB0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q80UB0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q80UB0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q80UB0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q80UB0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q80UB0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q80UB0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q80UB0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q80UB0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q80UB0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q80UB0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q80UB0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q80UB0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q80UB0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q80UB0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q80UB0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q80UB0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q80UB0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q80UB0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q80UB0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q80UB0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q80UB0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q80UB0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q80UB0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q80UB0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q80UB0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q80UB0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q80UB0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q80UB0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q80UB0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q80UB0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q80UB0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q80UB0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q80UB0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q80UB0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q80UB0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q80UB0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q80UB0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q80UB0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q80UB0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q80UB0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q80UB0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q80UB0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q80UB0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q80UB0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q80UB0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q80UB0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q80UB0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q80UB0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q80UB0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q80UB0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q80UB0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q80UB0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q80UB0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q80UB0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q80UB0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q80UB0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q80UB0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q80UB0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q80UB0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q80UB0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q80UB0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q80UB0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q80UB0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q80UB0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q80UB0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q80UB0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q80UB0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q80UB0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q80UB0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q80UB0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q80UB0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q80UB0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q80UB0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q80UB0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q80UB0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q80UB0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q80UB0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Q80UB0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q80UB0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q80UB0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q80UB0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q80UB0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q80UB0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q80UB0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q80UB0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q80UB0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q80UB0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q80UB0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms