Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS73

Rflna, Refilin-A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RflnaQ7TS73 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RflnaQ7TS73 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RflnaQ7TS73 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RflnaQ7TS73 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RflnaQ7TS73 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RflnaQ7TS73 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RflnaQ7TS73 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RflnaQ7TS73 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RflnaQ7TS73 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RflnaQ7TS73 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RflnaQ7TS73 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RflnaQ7TS73 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RflnaQ7TS73 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RflnaQ7TS73 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RflnaQ7TS73 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RflnaQ7TS73 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RflnaQ7TS73 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RflnaQ7TS73 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RflnaQ7TS73 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RflnaQ7TS73 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RflnaQ7TS73 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RflnaQ7TS73 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RflnaQ7TS73 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RflnaQ7TS73 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RflnaQ7TS73 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RflnaQ7TS73 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RflnaQ7TS73 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RflnaQ7TS73 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RflnaQ7TS73 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RflnaQ7TS73 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RflnaQ7TS73 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RflnaQ7TS73 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RflnaQ7TS73 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RflnaQ7TS73 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RflnaQ7TS73 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RflnaQ7TS73 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RflnaQ7TS73 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RflnaQ7TS73 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RflnaQ7TS73 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RflnaQ7TS73 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RflnaQ7TS73 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RflnaQ7TS73 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RflnaQ7TS73 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RflnaQ7TS73 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RflnaQ7TS73 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RflnaQ7TS73 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RflnaQ7TS73 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RflnaQ7TS73 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RflnaQ7TS73 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RflnaQ7TS73 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RflnaQ7TS73 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RflnaQ7TS73 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RflnaQ7TS73 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RflnaQ7TS73 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RflnaQ7TS73 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RflnaQ7TS73 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RflnaQ7TS73 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RflnaQ7TS73 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RflnaQ7TS73 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RflnaQ7TS73 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RflnaQ7TS73 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RflnaQ7TS73 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RflnaQ7TS73 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RflnaQ7TS73 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RflnaQ7TS73 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RflnaQ7TS73 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RflnaQ7TS73 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RflnaQ7TS73 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RflnaQ7TS73 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RflnaQ7TS73 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RflnaQ7TS73 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RflnaQ7TS73 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RflnaQ7TS73 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RflnaQ7TS73 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RflnaQ7TS73 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RflnaQ7TS73 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RflnaQ7TS73 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RflnaQ7TS73 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RflnaQ7TS73 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RflnaQ7TS73 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RflnaQ7TS73 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RflnaQ7TS73 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RflnaQ7TS73 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RflnaQ7TS73 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RflnaQ7TS73 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RflnaQ7TS73 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RflnaQ7TS73 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RflnaQ7TS73 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RflnaQ7TS73 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RflnaQ7TS73 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RflnaQ7TS73 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RflnaQ7TS73 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RflnaQ7TS73 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RflnaQ7TS73 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RflnaQ7TS73 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RflnaQ7TS73 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RflnaQ7TS73 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RflnaQ7TS73 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RflnaQ7TS73 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RflnaQ7TS73 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms