Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clec4b1Q7TS58 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec4b1Q7TS58 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clec4b1Q7TS58 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Clec4b1Q7TS58 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clec4b1Q7TS58 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clec4b1Q7TS58 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clec4b1Q7TS58 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec4b1Q7TS58 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec4b1Q7TS58 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clec4b1Q7TS58 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clec4b1Q7TS58 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clec4b1Q7TS58 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec4b1Q7TS58 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clec4b1Q7TS58 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clec4b1Q7TS58 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clec4b1Q7TS58 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clec4b1Q7TS58 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clec4b1Q7TS58 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clec4b1Q7TS58 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clec4b1Q7TS58 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clec4b1Q7TS58 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec4b1Q7TS58 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clec4b1Q7TS58 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clec4b1Q7TS58 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clec4b1Q7TS58 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4b1Q7TS58 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4b1Q7TS58 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clec4b1Q7TS58 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clec4b1Q7TS58 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clec4b1Q7TS58 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec4b1Q7TS58 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec4b1Q7TS58 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec4b1Q7TS58 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec4b1Q7TS58 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clec4b1Q7TS58 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec4b1Q7TS58 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clec4b1Q7TS58 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clec4b1Q7TS58 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec4b1Q7TS58 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clec4b1Q7TS58 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clec4b1Q7TS58 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec4b1Q7TS58 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec4b1Q7TS58 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec4b1Q7TS58 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4b1Q7TS58 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4b1Q7TS58 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4b1Q7TS58 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clec4b1Q7TS58 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clec4b1Q7TS58 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec4b1Q7TS58 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec4b1Q7TS58 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec4b1Q7TS58 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec4b1Q7TS58 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec4b1Q7TS58 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec4b1Q7TS58 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec4b1Q7TS58 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec4b1Q7TS58 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec4b1Q7TS58 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec4b1Q7TS58 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec4b1Q7TS58 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec4b1Q7TS58 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec4b1Q7TS58 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec4b1Q7TS58 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clec4b1Q7TS58 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clec4b1Q7TS58 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec4b1Q7TS58 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec4b1Q7TS58 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec4b1Q7TS58 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec4b1Q7TS58 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec4b1Q7TS58 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec4b1Q7TS58 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec4b1Q7TS58 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec4b1Q7TS58 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clec4b1Q7TS58 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec4b1Q7TS58 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec4b1Q7TS58 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec4b1Q7TS58 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec4b1Q7TS58 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec4b1Q7TS58 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec4b1Q7TS58 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec4b1Q7TS58 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec4b1Q7TS58 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec4b1Q7TS58 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clec4b1Q7TS58 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clec4b1Q7TS58 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms