Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQC5

Aptx, Aprataxin, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AptxQ7TQC5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AptxQ7TQC5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AptxQ7TQC5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AptxQ7TQC5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AptxQ7TQC5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AptxQ7TQC5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AptxQ7TQC5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AptxQ7TQC5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AptxQ7TQC5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AptxQ7TQC5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AptxQ7TQC5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AptxQ7TQC5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AptxQ7TQC5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AptxQ7TQC5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AptxQ7TQC5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AptxQ7TQC5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AptxQ7TQC5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AptxQ7TQC5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AptxQ7TQC5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AptxQ7TQC5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AptxQ7TQC5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AptxQ7TQC5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AptxQ7TQC5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AptxQ7TQC5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AptxQ7TQC5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AptxQ7TQC5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AptxQ7TQC5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AptxQ7TQC5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AptxQ7TQC5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AptxQ7TQC5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AptxQ7TQC5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AptxQ7TQC5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AptxQ7TQC5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AptxQ7TQC5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AptxQ7TQC5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AptxQ7TQC5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AptxQ7TQC5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AptxQ7TQC5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AptxQ7TQC5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AptxQ7TQC5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AptxQ7TQC5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AptxQ7TQC5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AptxQ7TQC5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AptxQ7TQC5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AptxQ7TQC5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AptxQ7TQC5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AptxQ7TQC5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AptxQ7TQC5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AptxQ7TQC5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AptxQ7TQC5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AptxQ7TQC5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AptxQ7TQC5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AptxQ7TQC5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AptxQ7TQC5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AptxQ7TQC5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AptxQ7TQC5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AptxQ7TQC5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AptxQ7TQC5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AptxQ7TQC5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AptxQ7TQC5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AptxQ7TQC5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AptxQ7TQC5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AptxQ7TQC5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AptxQ7TQC5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AptxQ7TQC5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AptxQ7TQC5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AptxQ7TQC5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AptxQ7TQC5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AptxQ7TQC5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AptxQ7TQC5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AptxQ7TQC5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AptxQ7TQC5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AptxQ7TQC5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AptxQ7TQC5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AptxQ7TQC5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AptxQ7TQC5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AptxQ7TQC5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AptxQ7TQC5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AptxQ7TQC5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AptxQ7TQC5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AptxQ7TQC5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AptxQ7TQC5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AptxQ7TQC5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AptxQ7TQC5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AptxQ7TQC5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms