Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox11Q7M6Y2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox11Q7M6Y2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox11Q7M6Y2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox11Q7M6Y2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox11Q7M6Y2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox11Q7M6Y2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox11Q7M6Y2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sox11Q7M6Y2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox11Q7M6Y2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox11Q7M6Y2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox11Q7M6Y2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox11Q7M6Y2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox11Q7M6Y2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox11Q7M6Y2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox11Q7M6Y2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox11Q7M6Y2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox11Q7M6Y2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sox11Q7M6Y2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox11Q7M6Y2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox11Q7M6Y2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox11Q7M6Y2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox11Q7M6Y2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox11Q7M6Y2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox11Q7M6Y2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox11Q7M6Y2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox11Q7M6Y2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox11Q7M6Y2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox11Q7M6Y2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox11Q7M6Y2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox11Q7M6Y2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox11Q7M6Y2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox11Q7M6Y2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox11Q7M6Y2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox11Q7M6Y2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox11Q7M6Y2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sox11Q7M6Y2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox11Q7M6Y2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sox11Q7M6Y2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox11Q7M6Y2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox11Q7M6Y2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox11Q7M6Y2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox11Q7M6Y2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox11Q7M6Y2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox11Q7M6Y2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox11Q7M6Y2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox11Q7M6Y2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox11Q7M6Y2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox11Q7M6Y2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox11Q7M6Y2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox11Q7M6Y2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sox11Q7M6Y2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox11Q7M6Y2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox11Q7M6Y2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox11Q7M6Y2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox11Q7M6Y2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox11Q7M6Y2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox11Q7M6Y2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sox11Q7M6Y2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox11Q7M6Y2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sox11Q7M6Y2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox11Q7M6Y2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sox11Q7M6Y2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox11Q7M6Y2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sox11Q7M6Y2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sox11Q7M6Y2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox11Q7M6Y2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sox11Q7M6Y2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox11Q7M6Y2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sox11Q7M6Y2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox11Q7M6Y2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox11Q7M6Y2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sox11Q7M6Y2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sox11Q7M6Y2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox11Q7M6Y2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sox11Q7M6Y2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox11Q7M6Y2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sox11Q7M6Y2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox11Q7M6Y2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sox11Q7M6Y2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox11Q7M6Y2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox11Q7M6Y2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox11Q7M6Y2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sox11Q7M6Y2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms