Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnih3Q6ZWS4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnih3Q6ZWS4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cnih3Q6ZWS4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnih3Q6ZWS4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnih3Q6ZWS4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnih3Q6ZWS4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnih3Q6ZWS4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnih3Q6ZWS4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnih3Q6ZWS4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnih3Q6ZWS4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnih3Q6ZWS4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnih3Q6ZWS4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnih3Q6ZWS4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnih3Q6ZWS4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnih3Q6ZWS4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnih3Q6ZWS4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnih3Q6ZWS4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnih3Q6ZWS4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnih3Q6ZWS4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnih3Q6ZWS4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnih3Q6ZWS4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnih3Q6ZWS4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms