Protein–RNA interactions for Protein: Q6XJV4

Cd200r4, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r4Q6XJV4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd200r4Q6XJV4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd200r4Q6XJV4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd200r4Q6XJV4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd200r4Q6XJV4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd200r4Q6XJV4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd200r4Q6XJV4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd200r4Q6XJV4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd200r4Q6XJV4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd200r4Q6XJV4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd200r4Q6XJV4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd200r4Q6XJV4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd200r4Q6XJV4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd200r4Q6XJV4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd200r4Q6XJV4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd200r4Q6XJV4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd200r4Q6XJV4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd200r4Q6XJV4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd200r4Q6XJV4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd200r4Q6XJV4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd200r4Q6XJV4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd200r4Q6XJV4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd200r4Q6XJV4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd200r4Q6XJV4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd200r4Q6XJV4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd200r4Q6XJV4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd200r4Q6XJV4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd200r4Q6XJV4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd200r4Q6XJV4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd200r4Q6XJV4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd200r4Q6XJV4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd200r4Q6XJV4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd200r4Q6XJV4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd200r4Q6XJV4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd200r4Q6XJV4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd200r4Q6XJV4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd200r4Q6XJV4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms