Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bnip1Q6QD59 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bnip1Q6QD59 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bnip1Q6QD59 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bnip1Q6QD59 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bnip1Q6QD59 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bnip1Q6QD59 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bnip1Q6QD59 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bnip1Q6QD59 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bnip1Q6QD59 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bnip1Q6QD59 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bnip1Q6QD59 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bnip1Q6QD59 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bnip1Q6QD59 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bnip1Q6QD59 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bnip1Q6QD59 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Bnip1Q6QD59 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bnip1Q6QD59 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bnip1Q6QD59 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bnip1Q6QD59 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bnip1Q6QD59 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bnip1Q6QD59 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bnip1Q6QD59 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bnip1Q6QD59 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bnip1Q6QD59 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bnip1Q6QD59 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bnip1Q6QD59 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bnip1Q6QD59 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bnip1Q6QD59 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bnip1Q6QD59 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bnip1Q6QD59 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnip1Q6QD59 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnip1Q6QD59 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnip1Q6QD59 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnip1Q6QD59 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bnip1Q6QD59 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bnip1Q6QD59 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnip1Q6QD59 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bnip1Q6QD59 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bnip1Q6QD59 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bnip1Q6QD59 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bnip1Q6QD59 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bnip1Q6QD59 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnip1Q6QD59 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnip1Q6QD59 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnip1Q6QD59 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bnip1Q6QD59 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bnip1Q6QD59 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bnip1Q6QD59 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bnip1Q6QD59 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bnip1Q6QD59 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bnip1Q6QD59 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bnip1Q6QD59 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bnip1Q6QD59 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bnip1Q6QD59 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bnip1Q6QD59 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bnip1Q6QD59 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bnip1Q6QD59 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bnip1Q6QD59 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bnip1Q6QD59 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bnip1Q6QD59 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bnip1Q6QD59 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bnip1Q6QD59 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bnip1Q6QD59 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bnip1Q6QD59 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bnip1Q6QD59 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bnip1Q6QD59 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnip1Q6QD59 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnip1Q6QD59 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnip1Q6QD59 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bnip1Q6QD59 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bnip1Q6QD59 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bnip1Q6QD59 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bnip1Q6QD59 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bnip1Q6QD59 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bnip1Q6QD59 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bnip1Q6QD59 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bnip1Q6QD59 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bnip1Q6QD59 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bnip1Q6QD59 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bnip1Q6QD59 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bnip1Q6QD59 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bnip1Q6QD59 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Bnip1Q6QD59 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bnip1Q6QD59 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Bnip1Q6QD59 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms