Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CtifQ6PEE2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CtifQ6PEE2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CtifQ6PEE2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CtifQ6PEE2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CtifQ6PEE2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CtifQ6PEE2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CtifQ6PEE2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CtifQ6PEE2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CtifQ6PEE2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CtifQ6PEE2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CtifQ6PEE2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms