Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CtifQ6PEE2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CtifQ6PEE2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CtifQ6PEE2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CtifQ6PEE2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CtifQ6PEE2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CtifQ6PEE2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CtifQ6PEE2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CtifQ6PEE2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CtifQ6PEE2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CtifQ6PEE2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CtifQ6PEE2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CtifQ6PEE2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CtifQ6PEE2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CtifQ6PEE2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CtifQ6PEE2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CtifQ6PEE2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CtifQ6PEE2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CtifQ6PEE2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CtifQ6PEE2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CtifQ6PEE2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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