Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mfsd4aQ6PDC8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mfsd4aQ6PDC8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mfsd4aQ6PDC8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mfsd4aQ6PDC8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mfsd4aQ6PDC8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mfsd4aQ6PDC8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mfsd4aQ6PDC8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mfsd4aQ6PDC8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mfsd4aQ6PDC8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mfsd4aQ6PDC8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mfsd4aQ6PDC8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mfsd4aQ6PDC8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mfsd4aQ6PDC8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mfsd4aQ6PDC8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mfsd4aQ6PDC8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mfsd4aQ6PDC8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mfsd4aQ6PDC8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mfsd4aQ6PDC8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mfsd4aQ6PDC8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mfsd4aQ6PDC8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mfsd4aQ6PDC8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mfsd4aQ6PDC8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mfsd4aQ6PDC8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mfsd4aQ6PDC8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mfsd4aQ6PDC8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mfsd4aQ6PDC8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Mfsd4aQ6PDC8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mfsd4aQ6PDC8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mfsd4aQ6PDC8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mfsd4aQ6PDC8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mfsd4aQ6PDC8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mfsd4aQ6PDC8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mfsd4aQ6PDC8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mfsd4aQ6PDC8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mfsd4aQ6PDC8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mfsd4aQ6PDC8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mfsd4aQ6PDC8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mfsd4aQ6PDC8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mfsd4aQ6PDC8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mfsd4aQ6PDC8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mfsd4aQ6PDC8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mfsd4aQ6PDC8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Mfsd4aQ6PDC8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mfsd4aQ6PDC8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mfsd4aQ6PDC8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mfsd4aQ6PDC8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mfsd4aQ6PDC8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mfsd4aQ6PDC8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mfsd4aQ6PDC8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mfsd4aQ6PDC8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mfsd4aQ6PDC8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mfsd4aQ6PDC8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mfsd4aQ6PDC8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mfsd4aQ6PDC8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mfsd4aQ6PDC8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mfsd4aQ6PDC8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mfsd4aQ6PDC8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Mfsd4aQ6PDC8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mfsd4aQ6PDC8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mfsd4aQ6PDC8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mfsd4aQ6PDC8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Mfsd4aQ6PDC8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mfsd4aQ6PDC8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mfsd4aQ6PDC8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mfsd4aQ6PDC8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mfsd4aQ6PDC8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mfsd4aQ6PDC8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Mfsd4aQ6PDC8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mfsd4aQ6PDC8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mfsd4aQ6PDC8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mfsd4aQ6PDC8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mfsd4aQ6PDC8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mfsd4aQ6PDC8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mfsd4aQ6PDC8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mfsd4aQ6PDC8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mfsd4aQ6PDC8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mfsd4aQ6PDC8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mfsd4aQ6PDC8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mfsd4aQ6PDC8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Mfsd4aQ6PDC8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mfsd4aQ6PDC8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mfsd4aQ6PDC8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mfsd4aQ6PDC8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mfsd4aQ6PDC8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mfsd4aQ6PDC8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mfsd4aQ6PDC8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mfsd4aQ6PDC8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mfsd4aQ6PDC8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms