Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rundc3bQ6PDC0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc3bQ6PDC0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rundc3bQ6PDC0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rundc3bQ6PDC0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rundc3bQ6PDC0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rundc3bQ6PDC0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rundc3bQ6PDC0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rundc3bQ6PDC0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc3bQ6PDC0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rundc3bQ6PDC0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc3bQ6PDC0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rundc3bQ6PDC0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rundc3bQ6PDC0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rundc3bQ6PDC0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rundc3bQ6PDC0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc3bQ6PDC0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rundc3bQ6PDC0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc3bQ6PDC0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc3bQ6PDC0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rundc3bQ6PDC0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc3bQ6PDC0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc3bQ6PDC0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc3bQ6PDC0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc3bQ6PDC0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc3bQ6PDC0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc3bQ6PDC0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rundc3bQ6PDC0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc3bQ6PDC0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rundc3bQ6PDC0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rundc3bQ6PDC0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rundc3bQ6PDC0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rundc3bQ6PDC0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rundc3bQ6PDC0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rundc3bQ6PDC0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rundc3bQ6PDC0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rundc3bQ6PDC0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rundc3bQ6PDC0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rundc3bQ6PDC0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc3bQ6PDC0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc3bQ6PDC0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc3bQ6PDC0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rundc3bQ6PDC0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc3bQ6PDC0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc3bQ6PDC0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc3bQ6PDC0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc3bQ6PDC0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc3bQ6PDC0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc3bQ6PDC0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc3bQ6PDC0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc3bQ6PDC0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc3bQ6PDC0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc3bQ6PDC0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rundc3bQ6PDC0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rundc3bQ6PDC0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rundc3bQ6PDC0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc3bQ6PDC0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rundc3bQ6PDC0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rundc3bQ6PDC0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rundc3bQ6PDC0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc3bQ6PDC0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc3bQ6PDC0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rundc3bQ6PDC0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc3bQ6PDC0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rundc3bQ6PDC0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rundc3bQ6PDC0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rundc3bQ6PDC0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms