Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BcrQ6PAJ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BcrQ6PAJ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BcrQ6PAJ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BcrQ6PAJ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BcrQ6PAJ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BcrQ6PAJ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BcrQ6PAJ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BcrQ6PAJ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BcrQ6PAJ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BcrQ6PAJ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BcrQ6PAJ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BcrQ6PAJ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BcrQ6PAJ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BcrQ6PAJ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BcrQ6PAJ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BcrQ6PAJ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BcrQ6PAJ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
BcrQ6PAJ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BcrQ6PAJ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BcrQ6PAJ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BcrQ6PAJ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BcrQ6PAJ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BcrQ6PAJ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BcrQ6PAJ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BcrQ6PAJ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BcrQ6PAJ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BcrQ6PAJ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BcrQ6PAJ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BcrQ6PAJ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
BcrQ6PAJ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BcrQ6PAJ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BcrQ6PAJ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BcrQ6PAJ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BcrQ6PAJ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BcrQ6PAJ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BcrQ6PAJ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BcrQ6PAJ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
BcrQ6PAJ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BcrQ6PAJ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BcrQ6PAJ1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BcrQ6PAJ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BcrQ6PAJ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BcrQ6PAJ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BcrQ6PAJ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BcrQ6PAJ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
BcrQ6PAJ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BcrQ6PAJ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BcrQ6PAJ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BcrQ6PAJ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BcrQ6PAJ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BcrQ6PAJ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BcrQ6PAJ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BcrQ6PAJ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BcrQ6PAJ1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BcrQ6PAJ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BcrQ6PAJ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BcrQ6PAJ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BcrQ6PAJ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BcrQ6PAJ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BcrQ6PAJ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BcrQ6PAJ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BcrQ6PAJ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BcrQ6PAJ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BcrQ6PAJ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BcrQ6PAJ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BcrQ6PAJ1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BcrQ6PAJ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BcrQ6PAJ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
BcrQ6PAJ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BcrQ6PAJ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BcrQ6PAJ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BcrQ6PAJ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BcrQ6PAJ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BcrQ6PAJ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BcrQ6PAJ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BcrQ6PAJ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BcrQ6PAJ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BcrQ6PAJ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BcrQ6PAJ1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BcrQ6PAJ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BcrQ6PAJ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BcrQ6PAJ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BcrQ6PAJ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BcrQ6PAJ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BcrQ6PAJ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BcrQ6PAJ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BcrQ6PAJ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BcrQ6PAJ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BcrQ6PAJ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BcrQ6PAJ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BcrQ6PAJ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BcrQ6PAJ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BcrQ6PAJ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BcrQ6PAJ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BcrQ6PAJ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BcrQ6PAJ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BcrQ6PAJ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BcrQ6PAJ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BcrQ6PAJ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms