Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf728Q6P5C7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf728Q6P5C7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf728Q6P5C7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf728Q6P5C7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf728Q6P5C7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf728Q6P5C7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf728Q6P5C7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf728Q6P5C7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf728Q6P5C7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf728Q6P5C7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf728Q6P5C7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf728Q6P5C7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf728Q6P5C7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf728Q6P5C7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf728Q6P5C7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf728Q6P5C7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf728Q6P5C7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf728Q6P5C7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf728Q6P5C7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf728Q6P5C7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf728Q6P5C7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf728Q6P5C7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf728Q6P5C7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf728Q6P5C7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf728Q6P5C7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf728Q6P5C7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf728Q6P5C7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf728Q6P5C7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf728Q6P5C7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf728Q6P5C7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf728Q6P5C7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf728Q6P5C7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf728Q6P5C7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf728Q6P5C7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf728Q6P5C7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf728Q6P5C7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf728Q6P5C7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf728Q6P5C7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf728Q6P5C7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf728Q6P5C7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf728Q6P5C7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf728Q6P5C7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf728Q6P5C7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf728Q6P5C7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf728Q6P5C7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf728Q6P5C7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf728Q6P5C7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf728Q6P5C7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf728Q6P5C7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf728Q6P5C7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf728Q6P5C7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf728Q6P5C7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf728Q6P5C7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf728Q6P5C7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf728Q6P5C7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf728Q6P5C7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf728Q6P5C7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf728Q6P5C7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf728Q6P5C7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf728Q6P5C7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf728Q6P5C7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf728Q6P5C7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf728Q6P5C7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf728Q6P5C7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf728Q6P5C7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf728Q6P5C7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf728Q6P5C7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf728Q6P5C7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf728Q6P5C7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf728Q6P5C7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf728Q6P5C7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf728Q6P5C7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf728Q6P5C7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf728Q6P5C7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf728Q6P5C7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf728Q6P5C7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf728Q6P5C7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf728Q6P5C7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf728Q6P5C7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf728Q6P5C7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf728Q6P5C7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf728Q6P5C7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf728Q6P5C7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf728Q6P5C7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf728Q6P5C7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf728Q6P5C7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf728Q6P5C7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf728Q6P5C7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf728Q6P5C7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf728Q6P5C7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf728Q6P5C7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf728Q6P5C7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf728Q6P5C7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf728Q6P5C7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf728Q6P5C7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf728Q6P5C7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf728Q6P5C7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf728Q6P5C7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Znf728Q6P5C7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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