Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Paxip1Q6NZQ4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Paxip1Q6NZQ4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Paxip1Q6NZQ4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Paxip1Q6NZQ4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Paxip1Q6NZQ4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Paxip1Q6NZQ4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Paxip1Q6NZQ4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Paxip1Q6NZQ4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Paxip1Q6NZQ4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Paxip1Q6NZQ4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Paxip1Q6NZQ4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Paxip1Q6NZQ4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Paxip1Q6NZQ4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Paxip1Q6NZQ4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Paxip1Q6NZQ4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Paxip1Q6NZQ4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Paxip1Q6NZQ4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Paxip1Q6NZQ4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Paxip1Q6NZQ4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Paxip1Q6NZQ4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Paxip1Q6NZQ4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Paxip1Q6NZQ4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Paxip1Q6NZQ4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Paxip1Q6NZQ4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Paxip1Q6NZQ4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Paxip1Q6NZQ4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Paxip1Q6NZQ4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Paxip1Q6NZQ4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Paxip1Q6NZQ4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Paxip1Q6NZQ4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Paxip1Q6NZQ4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Paxip1Q6NZQ4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Paxip1Q6NZQ4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Paxip1Q6NZQ4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Paxip1Q6NZQ4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Paxip1Q6NZQ4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Paxip1Q6NZQ4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Paxip1Q6NZQ4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Paxip1Q6NZQ4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Paxip1Q6NZQ4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Paxip1Q6NZQ4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Paxip1Q6NZQ4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Paxip1Q6NZQ4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Paxip1Q6NZQ4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Paxip1Q6NZQ4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Paxip1Q6NZQ4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Paxip1Q6NZQ4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Paxip1Q6NZQ4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Paxip1Q6NZQ4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Paxip1Q6NZQ4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Paxip1Q6NZQ4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Paxip1Q6NZQ4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Paxip1Q6NZQ4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Paxip1Q6NZQ4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Paxip1Q6NZQ4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Paxip1Q6NZQ4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Paxip1Q6NZQ4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Paxip1Q6NZQ4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Paxip1Q6NZQ4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Paxip1Q6NZQ4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Paxip1Q6NZQ4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Paxip1Q6NZQ4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Paxip1Q6NZQ4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Paxip1Q6NZQ4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Paxip1Q6NZQ4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Paxip1Q6NZQ4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Paxip1Q6NZQ4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Paxip1Q6NZQ4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Paxip1Q6NZQ4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Paxip1Q6NZQ4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Paxip1Q6NZQ4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Paxip1Q6NZQ4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Paxip1Q6NZQ4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Paxip1Q6NZQ4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Paxip1Q6NZQ4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Paxip1Q6NZQ4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Paxip1Q6NZQ4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Paxip1Q6NZQ4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Paxip1Q6NZQ4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Paxip1Q6NZQ4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Paxip1Q6NZQ4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Paxip1Q6NZQ4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Paxip1Q6NZQ4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Paxip1Q6NZQ4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Paxip1Q6NZQ4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Paxip1Q6NZQ4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Paxip1Q6NZQ4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Paxip1Q6NZQ4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Paxip1Q6NZQ4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Paxip1Q6NZQ4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Paxip1Q6NZQ4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Paxip1Q6NZQ4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Paxip1Q6NZQ4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Paxip1Q6NZQ4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Paxip1Q6NZQ4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Paxip1Q6NZQ4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Paxip1Q6NZQ4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Paxip1Q6NZQ4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms