Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP1

Zranb3, DNA annealing helicase and endonuclease ZRANB3, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb3Q6NZP1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Zranb3Q6NZP1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Zranb3Q6NZP1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Zranb3Q6NZP1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Zranb3Q6NZP1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Zranb3Q6NZP1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Zranb3Q6NZP1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Zranb3Q6NZP1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Zranb3Q6NZP1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Zranb3Q6NZP1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Zranb3Q6NZP1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Zranb3Q6NZP1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Zranb3Q6NZP1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Zranb3Q6NZP1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Zranb3Q6NZP1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Zranb3Q6NZP1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Zranb3Q6NZP1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Zranb3Q6NZP1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Zranb3Q6NZP1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Zranb3Q6NZP1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Zranb3Q6NZP1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Zranb3Q6NZP1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Zranb3Q6NZP1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Zranb3Q6NZP1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Zranb3Q6NZP1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Zranb3Q6NZP1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Zranb3Q6NZP1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Zranb3Q6NZP1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Zranb3Q6NZP1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Zranb3Q6NZP1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Zranb3Q6NZP1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Zranb3Q6NZP1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Zranb3Q6NZP1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Zranb3Q6NZP1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Zranb3Q6NZP1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Zranb3Q6NZP1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Zranb3Q6NZP1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Zranb3Q6NZP1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Zranb3Q6NZP1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Zranb3Q6NZP1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Zranb3Q6NZP1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Zranb3Q6NZP1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Zranb3Q6NZP1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Zranb3Q6NZP1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Zranb3Q6NZP1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Zranb3Q6NZP1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Zranb3Q6NZP1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Zranb3Q6NZP1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Zranb3Q6NZP1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Zranb3Q6NZP1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Zranb3Q6NZP1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Zranb3Q6NZP1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Zranb3Q6NZP1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Zranb3Q6NZP1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Zranb3Q6NZP1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Zranb3Q6NZP1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Zranb3Q6NZP1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Zranb3Q6NZP1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Zranb3Q6NZP1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Zranb3Q6NZP1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Zranb3Q6NZP1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Zranb3Q6NZP1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Zranb3Q6NZP1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Zranb3Q6NZP1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Zranb3Q6NZP1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Zranb3Q6NZP1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Zranb3Q6NZP1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Zranb3Q6NZP1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Zranb3Q6NZP1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Zranb3Q6NZP1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Zranb3Q6NZP1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Zranb3Q6NZP1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Zranb3Q6NZP1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Zranb3Q6NZP1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Zranb3Q6NZP1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Zranb3Q6NZP1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Zranb3Q6NZP1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Zranb3Q6NZP1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Zranb3Q6NZP1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Zranb3Q6NZP1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Zranb3Q6NZP1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Zranb3Q6NZP1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Zranb3Q6NZP1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Zranb3Q6NZP1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Zranb3Q6NZP1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Zranb3Q6NZP1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Zranb3Q6NZP1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Zranb3Q6NZP1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Zranb3Q6NZP1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Zranb3Q6NZP1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Zranb3Q6NZP1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Zranb3Q6NZP1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Zranb3Q6NZP1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Zranb3Q6NZP1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Zranb3Q6NZP1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Zranb3Q6NZP1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Zranb3Q6NZP1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Zranb3Q6NZP1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Zranb3Q6NZP1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Zranb3Q6NZP1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms