Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Wdr44Q6NVE8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Wdr44Q6NVE8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Wdr44Q6NVE8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Wdr44Q6NVE8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Wdr44Q6NVE8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Wdr44Q6NVE8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Wdr44Q6NVE8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Wdr44Q6NVE8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Wdr44Q6NVE8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Wdr44Q6NVE8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Wdr44Q6NVE8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Wdr44Q6NVE8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Wdr44Q6NVE8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Wdr44Q6NVE8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Wdr44Q6NVE8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Wdr44Q6NVE8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Wdr44Q6NVE8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Wdr44Q6NVE8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Wdr44Q6NVE8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Wdr44Q6NVE8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Wdr44Q6NVE8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Wdr44Q6NVE8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Wdr44Q6NVE8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Wdr44Q6NVE8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Wdr44Q6NVE8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Wdr44Q6NVE8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Wdr44Q6NVE8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Wdr44Q6NVE8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Wdr44Q6NVE8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Wdr44Q6NVE8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Wdr44Q6NVE8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Wdr44Q6NVE8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Wdr44Q6NVE8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Wdr44Q6NVE8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Wdr44Q6NVE8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Wdr44Q6NVE8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Wdr44Q6NVE8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Wdr44Q6NVE8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Wdr44Q6NVE8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Wdr44Q6NVE8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Wdr44Q6NVE8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Wdr44Q6NVE8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Wdr44Q6NVE8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Wdr44Q6NVE8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Wdr44Q6NVE8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Wdr44Q6NVE8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Wdr44Q6NVE8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Wdr44Q6NVE8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Wdr44Q6NVE8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Wdr44Q6NVE8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Wdr44Q6NVE8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Wdr44Q6NVE8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Wdr44Q6NVE8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Wdr44Q6NVE8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Wdr44Q6NVE8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Wdr44Q6NVE8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Wdr44Q6NVE8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Wdr44Q6NVE8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Wdr44Q6NVE8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Wdr44Q6NVE8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Wdr44Q6NVE8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Wdr44Q6NVE8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Wdr44Q6NVE8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Wdr44Q6NVE8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Wdr44Q6NVE8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Wdr44Q6NVE8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Wdr44Q6NVE8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Wdr44Q6NVE8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Wdr44Q6NVE8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Wdr44Q6NVE8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Wdr44Q6NVE8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Wdr44Q6NVE8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Wdr44Q6NVE8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Wdr44Q6NVE8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Wdr44Q6NVE8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Wdr44Q6NVE8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Wdr44Q6NVE8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Wdr44Q6NVE8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Wdr44Q6NVE8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Wdr44Q6NVE8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Wdr44Q6NVE8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Wdr44Q6NVE8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Wdr44Q6NVE8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Wdr44Q6NVE8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Wdr44Q6NVE8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Wdr44Q6NVE8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Wdr44Q6NVE8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Wdr44Q6NVE8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Wdr44Q6NVE8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Wdr44Q6NVE8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Wdr44Q6NVE8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Wdr44Q6NVE8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Wdr44Q6NVE8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Wdr44Q6NVE8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Wdr44Q6NVE8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Wdr44Q6NVE8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Wdr44Q6NVE8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms